当前解析结果
SmilChr04G000840| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000840 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000840 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000840 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 10612622 - 10613166 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022677 |
|---|---|
| GeneID | 131022677 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022677 |
| 原始查询 | SmilChr04G000840 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022677 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808176.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808176.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808176.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808176.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808176.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:10612656 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr4:10612664 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B95,C14 |
Chr4:10612664 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C14 |
Chr4:10612676 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 85 | A13,A2,A21,A24,A5,A6,B10,B101,B103,B104,B105,B106,B108,B11,B113,B114,B117,B122,B131,B135,B136,B139,B15,B16,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B37,B47,B56,B6,B60,B68,B74,B75,B80,B85,B88,B89,B93,B96,B98,C1,C10,C11,C13,C15,C22,C24,C28,C3,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C56,C63,C69,C70,C71,C73,C75,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C86,C9,D10,D11,D2,D5,D7 |
Chr4:10612699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr4:10612723 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B54 |
Chr4:10612723 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr4:10612731 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B41 |
Chr4:10612731 |
A |
ATC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr4:10612741 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B54 |
Chr4:10612753 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 128 | A1,A11,A13,A2,A24,A25,A3,A5,A6,A9,B10,B101,B104,B106,B108,B11,B112,B114,B115,B117,B121,B122,B128,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B139,B15,B18,B19,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B31,B37,B4,B42,B43,B44,B47,B49,B5,B50,B51,B55,B56,B59,B60,B63,B68,B7,B72,B73,B74,B79,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C15,C17,C22,C24,C26,C28,C3,C30,C33,C35,C37,C38,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C47,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C66,C69,C70,C71,C73,C75,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C86,C87,C9,D11,D5,D7,D8,D9 |
Chr4:10612772 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A13,C13 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。