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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000851`

染色体: Chr04 坐标: 10750160-10752278 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000851`
名称	SmilChr04G000851
描述	transcription repressor KAN1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10750160 - 10752278 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022686`
GeneID	`131022686`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022686`
原始查询	`SmilChr04G000851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor KAN1-like
产物	transcription repressor KAN1-like
Arabidopsis	`AT2G38300` (AT2G38300) myb-like HTH transcriptional regulator family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818410] identity=68.8; qcov=0.367; evalue=1.48e-52; confidence=low
Rice	`Os12g0105600` - identity=83.1; qcov=0.208; evalue=9.93e-35; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022686

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808180.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808180.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808180.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808180.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10750443`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:10750443`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B41
`Chr4:10750453`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	142	A1,A10,A11,A14,A16,A19,A20,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B100,B101,B102,B104,B105,B108,B109,B111,B112,B114,B117,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B128,B13,B132,B134,B135,B136,B137,B139,B15,B17,B18,B2,B20,B23,B25,B26,B27,B29,B3,B31,B33,B34,B37,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B56,B57,B58,B62,B65,B66,B69,B70,B72,B73,B74,B75,B78,B79,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B99,C10,C12,C14,C18,C20,C22,C27,C28,C3,C33,C35,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C47,C52,C55,C59,C6,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C70,C73,C76,C77,C79,C8,C82,C85,C87,D1,D11,D3,D4,D6,D9
`Chr4:10750517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,B98
`Chr4:10750719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B48
`Chr4:10750753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:10751693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B63
`Chr4:10751711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B96
`Chr4:10751736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D3
`Chr4:10751816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B79,C4,C70
`Chr4:10751907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:10751921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B65,B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808180.1

341 aa

170

341

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 64-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808180.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	64	115	6.6e-09	36.5	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952197.1
CAGATTCCCTTTGATTTTCCATAGATATATTATTAGTTTTTGAGGGACAAAGAGAAAGGAGAGAGAAAGAGCAGGGAAGAACTCTCTCATCTTCCTCTTACTAACGTTCTAGGGTTTCTTCATTAATCTCATCTATGCAGAGTTGCAGATCAAGATTCTACACTCTATTTTTCTTGGATTTCTCATCTTCTCCAACATGATCTTGAGGTTGTGAGAAAGCCCTAGCTAGTTCCCATCAATTGATGGATCATAGTATGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022686
ATGGAAATTAGTGAAAAAGAATGTCTGAAAAGAAGCCCTTGCGAGGGAATGGATGATGAAGATGAGAGCGAAGAGCAAAACGAGTTAAGCTTCGAGGAGGCGAAAGACGGAGGGAGCTCGAGCAACAGCACGGTGGAGGAGAGCGACAAGAAGCCGCCGGTGAGGCCTTATGTCCGGTCGAAGATGCCGAGGCTGCGGTGGACGCCGGAGCTCCACCTGCGCTTTGTTCACGCGGTGGAAAGACTCGGAGGCCAAGATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808180.1
MEISEKECLKRSPCEGMDDEDESEEQNELSFEEAKDGGSSSNSTVEESDKKPPVRPYVRSKMPRLRWTPELHLRFVHAVERLGGQDRATPKLVLQLMGIKGLNIAHVKSHLQMYRSKKTDESNQGLKFMEGVDRNIFNLSQLPLLPSFNQRPNSNLRYGDPTWMHNSAIGLNSRSITRPGFYTERFLSSHYTRLPSLNGSAWRNDDARLKEEKLGLIHKQEPWLGQTIQNPIEIDSLKQKLQEKRSSPPNLTQILSQERE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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