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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000856`

染色体: Chr04 坐标: 10869096-10869997 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000856`
名称	SmilChr04G000856
描述	uncharacterized SmilChr04G000856
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10869096 - 10869997 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022689`
GeneID	`131022689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022689`
原始查询	`SmilChr04G000856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0108200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0108200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G03450` (AT5G03450) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831835] identity=31.7; qcov=0.5; evalue=9.46e-06; confidence=low
Rice	`Os03g0108200` - identity=37.3; qcov=0.492; evalue=6.98e-07; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0036297 (interstrand cross-link repair); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808184.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808184.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808184.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808184.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10869420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr4:10869429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:10869439`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A25
`Chr4:10869439`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A25
`Chr4:10869443`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A25
`Chr4:10869443`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A25
`Chr4:10869580`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C51
`Chr4:10869580`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C51
`Chr4:10869752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B25,C84,C85
`Chr4:10869769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:10869821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	73	A1,A11,A13,A20,A22,A25,A3,A5,A7,B1,B100,B102,B112,B114,B117,B121,B125,B126,B128,B137,B14,B19,B31,B34,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B48,B51,B52,B54,B6,B65,B68,B69,B70,B71,B73,B77,B78,B8,B81,B88,B91,B95,B99,C12,C13,C14,C16,C2,C22,C32,C36,C4,C41,C48,C51,C52,C61,C62,C65,C67,C70,C77,C85,D1,D11,D3,D6
`Chr4:10869842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A16,B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952201.1
TTCACCGCTTCGAAGATTATGATGATTGGTCCTTCTACTACTACATGAAAACGCAGAATTTTAGTGGTGGATACGAGTTTGCCCTAGCTAATGAACTAGGGCGCGCCAACCTCAAAGAAAGCAAGGATCCGCGAGACGAAGGGAGTTCGGAGCCGCAGCCGCAGCCGCATCTAGAGCGACGAAAACACATTGTGGACGTAAACATAAAGTGTTACTTTTGTTCACGTCCAACACAAACCGGCGGCGAACATCAAATAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022689
ATGAAAACGCAGAATTTTAGTGGTGGATACGAGTTTGCCCTAGCTAATGAACTAGGGCGCGCCAACCTCAAAGAAAGCAAGGATCCGCGAGACGAAGGGAGTTCGGAGCCGCAGCCGCAGCCGCATCTAGAGCGACGAAAACACATTGTGGACGTAAACATAAAGTGTTACTTTTGTTCACGTCCAACACAAACCGGCGGCGAACATCAAATAAGTAATTTCCCTTGTGGATTAGTCTTTGGTTATTCATGCATGGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808184.1
MKTQNFSGGYEFALANELGRANLKESKDPRDEGSSEPQPQPHLERRKHIVDVNIKCYFCSRPTQTGGEHQISNFPCGLVFGYSCMEDKLPNENKTCPMCGEKHAEFDVTKLDIIPDQMMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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