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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000857`

染色体: Chr04 坐标: 10880055-10882936 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000857`
名称	SmilChr04G000857
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	10880055 - 10882936 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022988`
GeneID	`131022988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022988`
原始查询	`SmilChr04G000857`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=28.2; qcov=0.686; evalue=8.63e-80; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=32.5; qcov=0.676; evalue=1.12e-99; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808511.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808511.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808511.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808511.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:10880262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C84
`Chr4:10880267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:10880293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:10880454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B25,B5,C84,C85
`Chr4:10880475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D7
`Chr4:10880475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:10880540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C12
`Chr4:10880542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C11,C69
`Chr4:10880692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:10880712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:10880730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B2,B21,B36,B49,B61,B72,B90,B92,C29,C31,C49,C5,C71,C9
`Chr4:10880783`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A13,A2,B103,B106,B110,B131,B140,B18,B35,B59,B6,B7,B76,C1,C11,C13,C15,C2,C21,C37,C39,C4,C63,C69,C75,C80,C81,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808511.1

851 aa

426

851

FAR1

MULE

PF03101 FAR1 154-241 aa PF10551 MULE 367-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808511.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	154	241	5.1e-12	47.1	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057808511.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	367	461	1.5e-27	96.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952528.1
ATGGATTACGTTGTGCTTTGGCATACATTTGTGGAAGTCTTGAATATGTTAAATAATTTTGATGTATTTTGTGCAATGTGGTACAATTCATGTTCTGTGGAGTTGGTTGAAATAAGCTTCGATTTGAATGTTAGTTTGGGAGATGATGTTCGCGAACATAGTTTCATTCCCCACGTCGAAACGAGCGCATTTTCAAACACTGGTTCTGGTTTTGATGCAGAAAATTTAGTGGAACTGAACATTCCATTGTCTTCCTCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022988
ATGGATTACGTTGTGCTTTGGCATACATTTGTGGAAGTCTTGAATATGTTAAATAATTTTGATGTATTTTGTGCAATGTGGTACAATTCATGTTCTGTGGAGTTGGTTGAAATAAGCTTCGATTTGAATGTTAGTTTGGGAGATGATGTTCGCGAACATAGTTTCATTCCCCACGTCGAAACGAGCGCATTTTCAAACACTGGTTCTGGTTTTGATGCAGAAAATTTAGTGGAACTGAACATTCCATTGTCTTCCTCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808511.1
MDYVVLWHTFVEVLNMLNNFDVFCAMWYNSCSVELVEISFDLNVSLGDDVREHSFIPHVETSAFSNTGSGFDAENLVELNIPLSSSPEEDEPSPEEDQLGDSDDGDDLIPSINVDEGEDLPEESERSVQVSKNLVKGLIKVGRFVDTLDEVHVLYREYGRLKGFSVRKGTQSYFLHTKLVHVKFYHCSCEGSPDNKCSKDRVPVCKRQSYRCHCNAKLRVCREDVDSPWKVTIFETKHSHKSLHPSESYLLRSARNMSQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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