当前解析结果
SmilChr04G000869| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000869 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000869 |
| 描述 | uncharacterized protein At5g01610-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 10980515 - 11193688 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022705 |
|---|---|
| GeneID | 131022705 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022705 |
| 原始查询 | SmilChr04G000869 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | AT5G37070; symbol=AT5G37070; hit=AT5G37070; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | AT5G37070; symbol=AT5G37070; hit=AT5G37070; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G37070 (AT5G37070)- identity=82.9; qcov=1; evalue=4.5e-106; confidence=high |
| Rice | Os05g0346400- identity=76.5; qcov=1; evalue=3.93e-97; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04398 (DUF538) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022705 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057808205.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057808205.1 |
| 3 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.20000 | XP_057808205.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808205.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808205.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:10980942 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808205.1PF04398
DUF538 55-159 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808205.1 |
Pfam | PF04398 |
DUF538 | Family | 55 | 159 | 5.5e-30 | 104.8 | Protein of unknown function, DUF538 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。