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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000873`

染色体: Chr04 坐标: 11040833-11041393 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000873`
名称	SmilChr04G000873
描述	uncharacterized SmilChr04G000873
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11040833 - 11041393 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022994`
GeneID	`131022994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022994`
原始查询	`SmilChr04G000873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808515.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808515.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808515.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808515.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11040849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B138,B9,C72
`Chr4:11040859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11040887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C79
`Chr4:11040899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A15,A16,A19,A23,A9,B124,B130,B134,B2,B29,B42,B50,B58,B6,B60,B70,B9,B96,B98,C17,C18,C28,C39,C4,C45,C46,C53,C58,C60,C67,C68,C70,C82,C9,D7
`Chr4:11040918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11040935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr4:11040947`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B100,B12,B22,B78,C49,C57,C8
`Chr4:11040972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11040980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr4:11040980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:11040983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B110,C15,C2,C84
`Chr4:11040983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,C15,C2,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808515.1

152 aa

152

DUF8803

PF31073 DUF8803 66-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808515.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	66	119	1.1e-15	57.9	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952532.1
ATGGAGGCAATCATTCCAACCAAAAGCAAAATACCCACCTCCAGGACCGAGGTCGCCTCAGACAGCCAGAACGACGAAGCAATATGTCACGAGCTCGACACACTTGATGAAAAGAGAGATACAACAAGACTACGGCTTGCCTCATACCAGCAAAGTGTCTCCAGACACTACAACAGGCATGTTCACACTCAGACATTCAAGCTGGGCAATTGGGTGCTCCGATGTGTATTCCAAAACACTAAGGAGATCGGAGTTGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022994
ATGGAGGCAATCATTCCAACCAAAAGCAAAATACCCACCTCCAGGACCGAGGTCGCCTCAGACAGCCAGAACGACGAAGCAATATGTCACGAGCTCGACACACTTGATGAAAAGAGAGATACAACAAGACTACGGCTTGCCTCATACCAGCAAAGTGTCTCCAGACACTACAACAGGCATGTTCACACTCAGACATTCAAGCTGGGCAATTGGGTGCTCCGATGTGTATTCCAAAACACTAAGGAGATCGGAGTTGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808515.1
MEAIIPTKSKIPTSRTEVASDSQNDEAICHELDTLDEKRDTTRLRLASYQQSVSRHYNRHVHTQTFKLGNWVLRCVFQNTKEIGVGKLGPTWEGSYLITKLFGNDAYKLQDKDGRDIGNILSRPSRNYIGLDPVKGYVGNSTEHSSMEHSPA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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