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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000882`

染色体: Chr04 坐标: 11228638-11229478 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000882`
名称	SmilChr04G000882
描述	uncharacterized SmilChr04G000882
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11228638 - 11229478 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022996`
GeneID	`131022996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022996`
原始查询	`SmilChr04G000882`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26; qcov=0.866; evalue=5.66e-18; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=35.6; qcov=0.854; evalue=1.42e-38; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808518.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808518.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808518.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808518.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11228661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:11228676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:11228712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B48,B60,C2
`Chr4:11228857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B54,B64,C18
`Chr4:11228929`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	C21,C32,C55,C68,C73
`Chr4:11228929`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	C21,C32,C55,C68,C73
`Chr4:11228938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C21,C32,C55,C68,C73
`Chr4:11228949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C21,C32,C55,C68,C73
`Chr4:11228970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C9,D2
`Chr4:11228987`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A10,B103,B119,B121,B139,B70,B9,C3,C30,C34,C58
`Chr4:11229008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:11229025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B67,B7,C2,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808518.1

253 aa

126

253

SWIM

PF04434 SWIM 88-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808518.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	88	117	9.5e-09	35.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952535.1
ATGGTGGATAATAATATATCCGAGACTTTCAACGGATATATTTTGAATGCTAGGGAAAAATATGTTATGCACATGTTGGAGGAGATAAGAATTAGTTTGATGGTCAGGCAGGTTAAGAAAATGACAGACATTGATAAGGTGGAGGATACCTTGTGTCCATTGATTAGGAAAAAGCTAGATAAGCTATCTGCTGACTCAAAACATTGCATGCCTTACCCTGCATTAGGTGGAAAATTTGAAATTCATATAGAAGGGGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022996
ATGGTGGATAATAATATATCCGAGACTTTCAACGGATATATTTTGAATGCTAGGGAAAAATATGTTATGCACATGTTGGAGGAGATAAGAATTAGTTTGATGGTCAGGCAGGTTAAGAAAATGACAGACATTGATAAGGTGGAGGATACCTTGTGTCCATTGATTAGGAAAAAGCTAGATAAGCTATCTGCTGACTCAAAACATTGCATGCCTTACCCTGCATTAGGTGGAAAATTTGAAATTCATATAGAAGGGGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808518.1
MVDNNISETFNGYILNAREKYVMHMLEEIRISLMVRQVKKMTDIDKVEDTLCPLIRKKLDKLSADSKHCMPYPALGGKFEIHIEGDKFVVHVENRTCTCRVWQTVGIPCLHAIAAIEFMEHDPASYVNEYYTIEQYKQAYSFGLEPLNGERLWPQVEGYVVKPPSIRKMPGRPKLKRKRAAHEVDPVNPNKLRRHGQKITCKNCGQVGHNSRGCKNKTVVKVPKDKGKPGRPRTRSNPNEAGASNTEDREGTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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