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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000883`

染色体: Chr04 坐标: 11265925-11267310 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000883`
名称	SmilChr04G000883
描述	uncharacterized SmilChr04G000883
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11265925 - 11267310 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022998`
GeneID	`131022998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022998`
原始查询	`SmilChr04G000883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=26.1; qcov=0.74; evalue=5.46e-29; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.3; qcov=0.816; evalue=1.26e-35; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808519.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808519.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808519.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808519.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11265929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C9
`Chr4:11265954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:11265965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:11265986`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A11,A18,A4,A7,A8,B108,B109,B111,B13,B24,B27,B3,B31,B39,B42,B43,B46,B80,B86,B91,C11,C12,C13,C22,C4,C47,C55,C64,C69,C8,C82
`Chr4:11265993`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B120,B56,B60,B74,B96,C24
`Chr4:11265998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:11266008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:11266046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B111,B91,D7
`Chr4:11266078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B5,B67
`Chr4:11266079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B109,B3
`Chr4:11266204`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A2,B112,C1,C59,D2
`Chr4:11266204`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A2,B112,C1,C59,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808519.1

461 aa

230

461

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 1-217 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808519.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	1	217	4.6e-06	27.3	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952536.1
ATGGCCTGGAATGTCCGTGGGATGACAGACGAATCCAAGCGTTTGCTCAAAGAACATTGTAGTTTTTTTTCTCCTGTTATCTTGGGTATTATTGAACCTAAGAAAGCTCTTCGTAAAATTCGGCAAAATTTTTGGAATTCTTTGAATTTGGTTCCGGTGCATCAGAATTTTCGGGACCCTAGCTGTCCGAATATTTGGATCCTTGCTCAGCCTTCGATTGTCACCACTGTGATCTTTTCGTCGTCTCAGGCGGTTATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022998
ATGGCCTGGAATGTCCGTGGGATGACAGACGAATCCAAGCGTTTGCTCAAAGAACATTGTAGTTTTTTTTCTCCTGTTATCTTGGGTATTATTGAACCTAAGAAAGCTCTTCGTAAAATTCGGCAAAATTTTTGGAATTCTTTGAATTTGGTTCCGGTGCATCAGAATTTTCGGGACCCTAGCTGTCCGAATATTTGGATCCTTGCTCAGCCTTCGATTGTCACCACTGTGATCTTTTCGTCGTCTCAGGCGGTTATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808519.1
MAWNVRGMTDESKRLLKEHCSFFSPVILGIIEPKKALRKIRQNFWNSLNLVPVHQNFRDPSCPNIWILAQPSIVTTVIFSSSQAVIVDCIWQNLFFRVAIVHGANDQSLRRDLWRDMLHFSSGNTVFIGDFNAVKGAHERISSASPARSSCMDFCSFIGDTCFIESPTDGLRFTWSGHRFLPRHVESILDRALFSQSFADLWDSVVTSVLPRITSDHSPLVLRCNRFSYSGKRQFRFLNMWVLHPTFQEMVRTSWQNAVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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