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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000884`

染色体: Chr04 坐标: 11274878-11277912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000884`
名称	SmilChr04G000884
描述	protein trichome birefringence-like 35
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11274878 - 11277912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022709`
GeneID	`131022709`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022709`
原始查询	`SmilChr04G000884`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 35
产物	protein trichome birefringence-like 35
Arabidopsis	`AT5G01620` (TBL35) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 35 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831716] identity=62.1; qcov=0.916; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0817900` (OsTBL5) - identity=51.5; qcov=0.683; evalue=1.01e-127; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022709

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057808207.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808207.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808207.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808207.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11275108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:11276316`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr4:11276316`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr4:11276364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79
`Chr4:11276402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B64,C84
`Chr4:11276626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D4
`Chr4:11276843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:11277677`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B120,B62
`Chr4:11277677`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:11277695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808207.1

501 aa

250

501

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 162-215 aa PF13839 PC-Esterase 218-499 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808207.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	162	215	9.5e-23	81.0	PMR5 N terminal Domain
`XP_057808207.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	218	499	4.7e-85	286.7	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952224.1
TTAATAACCGAAAATCTCTGATCCAGAGAGAGCATGATTGTCGGACTTCATGCTTACTTCCATAATTAAATTACCAAAAATCTTTCTTCTTCTTAAATCTTTCCCAATCCCGTCGCTGTCGGCAGATGATCAAAACTCTTTCAAACTAATTTTCCTAATTTCAGCAGCAAGAAAAATTTTAAAAATGCAGCAACGATGGCAGAAGAAGAAGAAGCATTTCCCTCTCATCGCGCTCGCCTTCTTTGTTTTCATAGCTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022709
ATGCTTACTTCCATAATTAAATTACCAAAAATCTTTCTTCTTCTTAAATCTTTCCCAATCCCGTCGCTGTCGGCAGATGATCAAAACTCTTTCAAACTAATTTTCCTAATTTCAGCAGCAAGAAAAATTTTAAAAATGCAGCAACGATGGCAGAAGAAGAAGAAGCATTTCCCTCTCATCGCGCTCGCCTTCTTTGTTTTCATAGCTTTCTCAATTTTGTGCAGTGAGTCCAATATTCGAGTGATTCATCAGCACCGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808207.1
MLTSIIKLPKIFLLLKSFPIPSLSADDQNSFKLIFLISAARKILKMQQRWQKKKKHFPLIALAFFVFIAFSILCSESNIRVIHQHRARSDRNVEKQRSSLSQNGSLFYSTPAHTFNLSQKPPVGLDKFTTCATTVRYSGRRAVSAIHREEPGGRRAVSEVEGCDFFSGKWILDNVSYPLYNESHCPYMSDQLACHKHGRQDLGYQFWRWQPQNCNMKRWNALEMWEKLRGKRLMFVGDSLNRGQWISMLCLLQSVIPRDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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