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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000887`

染色体: Chr04 坐标: 11357065-11366190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000887`
名称	SmilChr04G000887
描述	uncharacterized SmilChr04G000887
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11357065 - 11366190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022999`
GeneID	`131022999`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022999`
原始查询	`SmilChr04G000887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0683500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=37.1; qcov=0.284; evalue=1.33e-07; confidence=weak
Rice	`Os06g0683500` - identity=31.5; qcov=0.406; evalue=5.31e-13; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022999

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808521.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808521.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808521.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057808521.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11357122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,C12,C54,C85
`Chr4:11357142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,C3,C39,C65
`Chr4:11357144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C54,C85
`Chr4:11357155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B70,B85,B99
`Chr4:11357158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C43,C72
`Chr4:11357161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B82,C20
`Chr4:11357174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr4:11357182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C54,C85
`Chr4:11357202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:11357230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B64
`Chr4:11357241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr4:11357243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808521.1

313 aa

156

313

RVT_3

PF13456 RVT_3 191-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808521.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	191	310	1.1e-17	64.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952538.1
ATGGGCACTTATCGCTTGATCGGGACTTGGGTGTTGAGCTGCTATTTTAGCAGATTTCTATATACGGCTGGAAGCTCGAGGATCTGTTCGGAACCTCATTCGGAGTCCAGCTTTATGGCCGATGCTTTGATGGTTCTGATGGGTGAGTTGGATGTGATAGCAGCTCTTTACATGCTGCGAGGGAATGGTAACGATCGCGCCGAGCTCCTCAAGACATCTGTCGAACAGCTGGCTCGCAATATTCACATGTTGGTGGCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022999
ATGGGCACTTATCGCTTGATCGGGACTTGGGTGTTGAGCTGCTATTTTAGCAGATTTCTATATACGGCTGGAAGCTCGAGGATCTGTTCGGAACCTCATTCGGAGTCCAGCTTTATGGCCGATGCTTTGATGGTTCTGATGGGTGAGTTGGATGTGATAGCAGCTCTTTACATGCTGCGAGGGAATGGTAACGATCGCGCCGAGCTCCTCAAGACATCTGTCGAACAGCTGGCTCGCAATATTCACATGTTGGTGGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808521.1
MGTYRLIGTWVLSCYFSRFLYTAGSSRICSEPHSESSFMADALMVLMGELDVIAALYMLRGNGNDRAELLKTSVEQLARNIHMLVAAWGYSFSSQLACFWKAGIISLIWSIWTQRNNCIFDDDKFEAKKIFHSIKVTFREMEENFKLGAMANTWEDLSILKKIGIKGRAAIPPDFINVYWWPPSNHWIKVNTDGSALGAPGKIAAGGVFRDNHSTVRGCFHKKRGIGYAFEAELLAVITAIQYANDRNWFYLWLESDSTY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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