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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000890`

染色体: Chr04 坐标: 11419139-11424440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000890`
名称	SmilChr04G000890
描述	protein DETOXIFICATION 44, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11419139 - 11424440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022715`
GeneID	`131022715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022715`
原始查询	`SmilChr04G000890`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DETOXIFICATION 44, chloroplastic
产物	protein DETOXIFICATION 44%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G38330` (AT2G38330) MATE efflux family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818413] identity=63.2; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0106600` - identity=58.9; qcov=0.913; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015297 (antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0042910 (xenobiotic transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01554 (MatE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057808209.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057808209.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808209.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808209.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11419456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:11420731`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B83
`Chr4:11420731`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B83
`Chr4:11421394`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B128,B66,C84
`Chr4:11421394`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B128,B66,C84
`Chr4:11421877`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	127	A1,A13,A16,A2,A22,A3,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B108,B110,B111,B115,B117,B118,B119,B121,B126,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B139,B14,B18,B20,B21,B23,B27,B30,B33,B34,B37,B40,B41,B46,B47,B48,B5,B50,B52,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B75,B76,B79,B8,B82,B84,B87,B90,B91,B95,B96,B97,B98,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C20,C21,C23,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C41,C47,C48,C5,C50,C52,C53,C56,C59,C6,C63,C64,C65,C66,C7,C70,C72,C75,C78,C84,C85,C87,D1,D10,D5,D7
`Chr4:11421879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C73
`Chr4:11422018`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	128	A1,A13,A2,A21,A24,A25,A6,A7,A8,A9,B1,B101,B102,B107,B108,B109,B11,B112,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B125,B127,B13,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B138,B140,B18,B21,B22,B25,B29,B31,B33,B35,B37,B38,B43,B44,B48,B5,B50,B52,B54,B56,B58,B6,B63,B66,B67,B68,B70,B71,B72,B74,B75,B76,B79,B8,B80,B82,B84,B85,B87,B88,B9,B90,B93,B94,B95,C1,C10,C11,C16,C19,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C34,C38,C40,C45,C46,C48,C5,C50,C57,C58,C59,C6,C64,C66,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C80,C82,C85,C87,C9,D3,D7,D8,D9
`Chr4:11422049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:11422050`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A13,A14,A4,B102,B11,B112,B114,B120,B25,B29,B33,B40,B47,B54,B76,B8,B9,B93,C16,C24,C29,C46,C57,C75,C80,D3
`Chr4:11422568`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A15,A23,A9,B10,B53,B56,B62,B96,C34,C62,C86,D2,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808209.1

552 aa

276

552

MatE

PF01554 MatE 114-287 aa PF01554 MatE 352-498 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808209.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	114	287	8.2e-25	88.1	MatE
`XP_057808209.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	352	498	8.2e-25	88.1	MatE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952226.1
GAAAAAGTGTGAGATATTTCACAACTGAGCTCTTACCACAGCCATTAAAAATTTGAGCACATAATCAAACAAAAACTCAATACTGTGTTGTTTCAATCTTCATAGATTTTCCGCTTTCTGAATCCGAGATTCATTCATACAAAAACTGCAAAATTCTTCGTCGCTTATTTCAGCTATGGCGTTTGGTGTTGCTGCGCAGCACCAACTCAGCCACCTTTTCTCCATTCATGCAAATTACAGCACCAACAACCACTCGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022715
ATGGCGTTTGGTGTTGCTGCGCAGCACCAACTCAGCCACCTTTTCTCCATTCATGCAAATTACAGCACCAACAACCACTCGCCGATTCACTACAGGTGCTCGACGAAATGCGCCAATGGCTATGGCTCGATTCGATTTCGAACGGTCGCAAAATCATCAACAAATAAAAATCCGAGCACCATGCCGGAGAAGCCGAAGCCGCCGGTTGAAGGAAATCGAATCGATGATTCGGATCCGGAACCGTATCCTGATCGGAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808209.1
MAFGVAAQHQLSHLFSIHANYSTNNHSPIHYRCSTKCANGYGSIRFRTVAKSSTNKNPSTMPEKPKPPVEGNRIDDSDPEPYPDRNLFSSVMHRLRAGIRLDGLGMEIISIALPAALALAADPITSLVDTGFVGHIGSAELAAVGVSGAVFNLVSKLFNVPLLNVTTSFVAEEQASALKAAGETAKEQQNKIFLPSVSNAIMLAAALGVVEAVALFMGSSFLMNTMGIPVDSPMRVPAEQFLALRAFGAPPIVVALAAQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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