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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000898`

染色体: Chr04 坐标: 11547810-11548814 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000898`
名称	SmilChr04G000898
描述	V-type proton ATPase subunit D-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	11547810 - 11548814 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022724`
GeneID	`131022724`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022724`
原始查询	`SmilChr04G000898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase subunit D-like
产物	V-type proton ATPase subunit D-like
Arabidopsis	`AT3G58730` (AT3G58730) vacuolar ATP synthase subunit D (VATD) / V-ATPase D subunit / vacuolar proton pump D subunit (VATPD) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825042] identity=78.9; qcov=1; evalue=3.16e-154; confidence=high
Rice	`Os04g0643100` - identity=73.6; qcov=1.03; evalue=2.07e-147; confidence=high
GO	GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0033176 (proton-transporting V-type ATPase complex); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01813 (ATP-synt_D)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022724

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057808219.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057808219.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057808219.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057808219.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057808219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:11548060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:11548233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:11548347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808219.1

260 aa

130

260

ATP-synt_D

PF01813 ATP-synt_D 17-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808219.1`	Pfam	`PF01813`	ATP-synt_D	Family	17	208	4.8e-67	226.3	ATP synthase subunit D

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952236.1
ATGTCCGGACAGACTCAGCGCTTGAATGTTGTTCCGACTGTGACAATGCTTGGAGTAATGAAAGCTCGACTGATTGGGGCTACGAGAGGCCATGCATTGCTCAAGAAGAAGAGTGATGCTCTGACTGTGCAATTTCGGGCAATCCTAAAGAAAATTGTTTCCACGAAGGAATCCATGGGAGATATCATGAAAACTTCCTCCTTTGCCCTTACAGAAGCTAAATATGTTGCTGGTGATAATATTAAGCACTCTATTCGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022724
ATGTCCGGACAGACTCAGCGCTTGAATGTTGTTCCGACTGTGACAATGCTTGGAGTAATGAAAGCTCGACTGATTGGGGCTACGAGAGGCCATGCATTGCTCAAGAAGAAGAGTGATGCTCTGACTGTGCAATTTCGGGCAATCCTAAAGAAAATTGTTTCCACGAAGGAATCCATGGGAGATATCATGAAAACTTCCTCCTTTGCCCTTACAGAAGCTAAATATGTTGCTGGTGATAATATTAAGCACTCTATTCGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808219.1
MSGQTQRLNVVPTVTMLGVMKARLIGATRGHALLKKKSDALTVQFRAILKKIVSTKESMGDIMKTSSFALTEAKYVAGDNIKHSIRENVKSASLKVRSHQENIAGVKLPKFEYFVDGETKNDLTGLARGGQQIQACRAAYVESIELLVELASLQTSFLTLDEAIKTTNRRVNALENVVKPRIDNTISYIKGELDELEREDFFRLKKIQGYKRREVDKQRESAKAYAEEKVAEEMSLQKGISLTSAHDLLSQSKKDEDIIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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