当前解析结果
SmilChr04G000923| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000923 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000923 |
| 描述 | alpha-soluble NSF attachment protein-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 12066016 - 12068780 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131022748 |
|---|---|
| GeneID | 131022748 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022748 |
| 原始查询 | SmilChr04G000923 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | alpha-soluble NSF attachment protein-like |
| 产物 | alpha-soluble NSF attachment protein-like |
| Arabidopsis | AT3G56190 (ALPHA-SNAP2)alpha-soluble NSF attachment protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824785] identity=65.4; qcov=1; evalue=9.24e-128; confidence=high |
| Rice | Os08g0282400- identity=63; qcov=1; evalue=6.78e-136; confidence=high |
| GO | GO:0005483 (soluble NSF attachment protein activity); GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0019905 (syntaxin binding); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0035494 (SNARE complex disassembly) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF14938 (SNAP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022748 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808253.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057808253.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057808253.1 |
| 4 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.20000 | XP_057808253.1 |
| 5 | Vesicle | 囊泡 | 0.20000 | XP_057808253.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808253.1PF14938
SNAP 7-279 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808253.1 |
Pfam | PF14938 |
SNAP | Repeat | 7 | 279 | 5.4e-105 | 351.6 | Soluble NSF attachment protein, SNAP |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。