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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000928`

染色体: Chr04 坐标: 12089431-12091955 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000928`
名称	SmilChr04G000928
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12089431 - 12091955 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023006`
GeneID	`131023006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023006`
原始查询	`SmilChr04G000928`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29.2; qcov=0.745; evalue=6.93e-86; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=33.5; qcov=0.721; evalue=5.38e-112; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808527.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808527.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808527.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808527.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12089714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B59,C16,C77
`Chr4:12089749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr4:12089758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:12089761`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B61
`Chr4:12089761`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B61
`Chr4:12089764`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B49,C53,D2
`Chr4:12089764`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B49,C53,D2
`Chr4:12089766`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A21,B129,B26,B97,C16,C77,D2
`Chr4:12089794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:12089804`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A14,A15,A24,B103,B105,B11,B110,B119,B125,B126,B21,B26,B30,B33,B5,B51,B57,B81,B84,B89,B90,B92,B96,B97,B98,C10,C15,C16,C21,C27,C31,C49,C55,C57,C8,C86,D4
`Chr4:12089855`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B10,B26,B51,B61,B70,B71,B92,C24,C62,C71
`Chr4:12089857`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B10,B26,B51,B61,B70,B71,B92,C24,C62,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808527.1

804 aa

402

804

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 110-198 aa PF10551 MULE 322-416 aa PF04434 SWIM 614-639 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808527.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	110	198	4.3e-16	60.1	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057808527.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	322	416	2.2e-28	99.2	MULE transposase domain
`XP_057808527.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	614	639	0.00018	21.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952544.1
ATGAGGATAGATTTGAACATATCTTATGTGAGTGATGTAGCTTCTGATTCCTTGAGTGGCAGAGGTAATCTGGGAGAATTTGGCTTTAGTGTATCCGGTGCAGAGACGGAGGTGTCTTCTAAAGAAGATTACCATTCGGACAAGAGCATATATGTAAATGAAGTCTTGGAAGAAGGTGACAGTAGTACACGAAACACTAGTACAAAATTTTTTGAACAAGAAAGGAGTGACGCAACAACCAATTCCGTTGATGTATTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023006
ATGAGGATAGATTTGAACATATCTTATGTGAGTGATGTAGCTTCTGATTCCTTGAGTGGCAGAGGTAATCTGGGAGAATTTGGCTTTAGTGTATCCGGTGCAGAGACGGAGGTGTCTTCTAAAGAAGATTACCATTCGGACAAGAGCATATATGTAAATGAAGTCTTGGAAGAAGGTGACAGTAGTACACGAAACACTAGTACAAAATTTTTTGAACAAGAAAGGAGTGACGCAACAACCAATTCCGTTGATGTATTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808527.1
MRIDLNISYVSDVASDSLSGRGNLGEFGFSVSGAETEVSSKEDYHSDKSIYVNEVLEEGDSSTRNTSTKFFEQERSDATTNSVDVLRNKSECMLSVGSVFDTLDEVFEAYCDYGGLMGFSARRSTQAYFTRTEIACSKVFVCSCAGLTDKKCSNGRVAAFKKQTYRTNCGARLRVGRTNVEAPWIVTLFEKQHNHQLLEPDASYLLRSARNIRESQKSLLIGMKSSGIGVSRAYRFLEKEAGSRANIGFTRTDVYNELNR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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