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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000938`

染色体: Chr04 坐标: 12271582-12273883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000938`
名称	SmilChr04G000938
描述	protein LURP-one-related 10-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12271582 - 12273883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022757`
GeneID	`131022757`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022757`
原始查询	`SmilChr04G000938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LURP-one-related 10-like
产物	protein LURP-one-related 10-like
Arabidopsis	`AT5G01750` (AT5G01750) LURP-one-like protein (DUF567) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831684] identity=47; qcov=0.719; evalue=3.77e-53; confidence=high
Rice	`Os07g0230700` - identity=36.9; qcov=0.693; evalue=6e-37; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04525 (LOR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022757

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808260.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808260.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808262.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808260.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808260.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12271708`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B106,B66,B82,C79,C80,C81,D5
`Chr4:12271970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:12272000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:12273108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A13,A25,B47,B8,B90,B92,B99,C47,C51,C61,C87
`Chr4:12273545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr4:12273561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B65
`Chr4:12273593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:12273623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:12273758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808260.1

258 aa

129

258

LOR

PF04525 LOR 20-197 aa

XP_057808261.1

251 aa

126

251

LOR

PF04525 LOR 20-190 aa

XP_057808262.1

238 aa

119

238

LOR

PF04525 LOR 12-177 aa

XP_057808263.1

231 aa

116

231

LOR

PF04525 LOR 12-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808260.1`	Pfam	`PF04525`	LOR	Domain	20	197	4.3e-41	141.9	LURP-one-related
`XP_057808261.1`	Pfam	`PF04525`	LOR	Domain	20	190	1.7e-42	146.4	LURP-one-related
`XP_057808262.1`	Pfam	`PF04525`	LOR	Domain	12	177	1.3e-38	133.8	LURP-one-related
`XP_057808263.1`	Pfam	`PF04525`	LOR	Domain	12	170	5.7e-40	138.2	LURP-one-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952279.1
CATGGAAACCCAGCATGAAACCTCTGCGAAAACCTTCTTAATTTCTCGAGTAGGAATTTATGGTTTTTGTCCAAGTTTCTAAGAATTTTCCTTCATTTTTGAAAACATGGAATTTTCCTTCTCAGCCACAACTTTGATTGGGCATGGAAACTTGGTCGTGAAAAATTCCGATGGCAATATCATGTTCAAAATCGAAGGATCGATCTTCAGCTTCAATGGCACGAGGGTTATGTCTGATGCTGTCGGTGCTCCTATTGTCA...

XM_057952280.1
CATGGAAACCCAGCATGAAACCTCTGCGAAAACCTTCTTAATTTCTCGAGTAGGAATTTATGGTTTTTGTCCAAGTTTCTAAGAATTTTCCTTCATTTTTGAAAACATGGAATTTTCCTTCTCAGCCACAACTTTGATTGGGCATGGAAACTTGGTCGTGAAAAATTCCGATGGCAATATCATGTTCAAAATCGAAGGATCGATCTTCAGCTTCAATGGCACGAGGGTTATGTCTGATGCTGTCGGTGCTCCTATTGTCA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131022757
ATGGAATTTTCCTTCTCAGCCACAACTTTGATTGGGCATGGAAACTTGGTCGTGAAAAATTCCGATGGCAATATCATGTTCAAAATCGAAGGATCGATCTTCAGCTTCAATGGCACGAGGGTTATGTCTGATGCTGTCGGTGCTCCTATTGTCACACTCCGGAAAAAAATATTCAGTGTTTTTGATACATGGAAGGTGTTTAGAGGTGAAGGCCAAGATAAAAGAGACCTAATCTTTATTGTGGAGAGGGCTTCCATTTT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057808260.1
MKTKDEIAVINPNFSIPLPVDLTITKSIWQIGHGNLVVKNSDGNIMFKIEGSIFSFNGTRVMSDAVGAPIVTLRKKIFSVFDTWKVFRGEGQDKRDLIFIVERASIFQMKTKLAVFLAENKYEDVCDYTVQTSWFERSCQVNVGDSSTKLAQVCISKTNMRKNSWLDRLFSGEDRFEVMVYPNVDCAFIVALIVILDEIVSNSRRSPKHKCNGGGVFSSLFLIVCFFFFFFLKHRQNRDTTFFCFHPTPQRDNLNYYS

XP_057808261.1
MKTKDEIAVINPNFSIPLPVDLTITKSIWQIGHGNLVVKNSDGNIMFKIEGSIFSFNGTRVMSDAVGAPIVTLRKKIFSVFDTWKVFRGEGQDKRDLIFIVERASIFQMKTKLAVFLAENKYEDVCDYTVQTSWFERSCQVNVGDSSTKLAQMRKNSWLDRLFSGEDRFEVMVYPNVDCAFIVALIVILDEIVSNSRRSPKHKCNGGGVFSSLFLIVCFFFFFFLKHRQNRDTTFFCFHPTPQRDNLNYYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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