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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000947`

染色体: Chr04 坐标: 12533260-12534608 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000947`
名称	SmilChr04G000947
描述	phosphoenolpyruvate carboxylase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12533260 - 12534608 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023013`
GeneID	`131023013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023013`
原始查询	`SmilChr04G000947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphoenolpyruvate carboxylase 2-like
产物	phosphoenolpyruvate carboxylase 2-like
Arabidopsis	`AT1G53310` (PPC1) phosphoenolpyruvate carboxylase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841765] identity=91.7; qcov=0.805; evalue=5.65e-143; confidence=high
Rice	`Os08g0366000` (Osppc) - identity=91.2; qcov=0.805; evalue=7.2e-143; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0008964 (phosphoenolpyruvate carboxylase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0015977 (carbon fixation); GO:0048046 (apoplast); GO:0048366 (leaf development)
KEGG	-
Pfam	PF00311 (PEPcase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057808533.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808533.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808533.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808533.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808533.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12533467`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C84
`Chr4:12533467`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C84
`Chr4:12533468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,D8
`Chr4:12533498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,D8
`Chr4:12533512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:12533513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B134,B25
`Chr4:12533516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B124,C70
`Chr4:12533523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr4:12533529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C57
`Chr4:12533533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr4:12533534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B49
`Chr4:12533535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808533.1

298 aa

149

298

PEPcase

PF00311 PEPcase 16-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808533.1`	Pfam	`PF00311`	PEPcase	Family	16	250	2.5e-109	367.3	Phosphoenolpyruvate carboxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952550.1
ATGGCATTGGGCCCCTTATGGCAAGGGGTGTGTCAAATAAGCCCCTATGTTTCGACGTTTGGACTCTCACTCGTGAGACTTGACATCCGGCAAGAGTCAGATAGGCACACCGATGTTCTGGATGCTATCACGAGGCACCTCGAAATCGGATCCTACAAGGAATGGCCTGAGGAGCGCCGTCAAGAATGGCTCTTATCTGAACTTAGTGGCAAGCGTCCGTTGTTTGGTCCGGACCTTCCAAAAACCGAGGAGATTGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023013
ATGGCATTGGGCCCCTTATGGCAAGGGGTGTGTCAAATAAGCCCCTATGTTTCGACGTTTGGACTCTCACTCGTGAGACTTGACATCCGGCAAGAGTCAGATAGGCACACCGATGTTCTGGATGCTATCACGAGGCACCTCGAAATCGGATCCTACAAGGAATGGCCTGAGGAGCGCCGTCAAGAATGGCTCTTATCTGAACTTAGTGGCAAGCGTCCGTTGTTTGGTCCGGACCTTCCAAAAACCGAGGAGATTGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808533.1
MALGPLWQGVCQISPYVSTFGLSLVRLDIRQESDRHTDVLDAITRHLEIGSYKEWPEERRQEWLLSELSGKRPLFGPDLPKTEEIADVLDTFHVIAELPSDNFGAYIISMATSPSDVLAVELLQRECHIKTPLRVVPLFEKLADLEAAPAAVARLFSIDWYRNRINGKQEVMIGYSDSGKDAGRLSAAWQLYKAQEELIKVAKEFGVKLTMFHGRGGTVGRGGGPTHLAILSQPPDTIHGSLRVTVQGEVGGGSGGGGSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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