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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000953`

染色体: Chr04 坐标: 12603765-12604337 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000953`
名称	SmilChr04G000953
描述	zinc transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12603765 - 12604337 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023015`
GeneID	`131023015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023015`
原始查询	`SmilChr04G000953`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc transporter 1-like
产物	zinc transporter 1-like
Arabidopsis	`AT3G12750` (ZIP1) zinc transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820457] identity=46; qcov=0.653; evalue=1.06e-30; confidence=medium
Rice	`Os03g0667500` (OsZIP10) - identity=47.1; qcov=0.626; evalue=1.2e-27; confidence=medium
GO	GO:0005385 (zinc ion transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0071577 (zinc ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02535 (Zip)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057808535.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057808535.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057808535.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057808535.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12603776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B20,B89,C18,C56
`Chr4:12603781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B20,B89,C18,C56
`Chr4:12603836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B102,B31,B42,B59,B79,C36,C41,C52,D3
`Chr4:12603879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	B102,B124,B125,B31,B42,B43,B59,B79,C36,C41,C52
`Chr4:12603912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,C79,C80,C81,D5
`Chr4:12603990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B16,B5,B67
`Chr4:12604039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:12604102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:12604109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:12604145`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A14,A19,A6,B117,B136,B45,B7,B72,B97,C20,C28,C3,C38,C40,C6,C81
`Chr4:12604172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B41,C13
`Chr4:12604173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808535.1

190 aa

190

Zip

PF02535 Zip 60-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808535.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	60	142	3.5e-12	46.9	ZIP Zinc transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952552.1
ATGGAAGATATATTGGACTCTACACTCTTACCCCACTTCAGATCACTCTGCGCCATGGCCACTGCTCACAAAATAATCTTCCTCATGGCTGTCTCAGCCGCTGCCTCAGCGGCCGCAGACGACTGCATGAGCTACGACACCGAAGCCGAGGAAGGCAACAAGAGCGAAGCCCTAAAGCTGAAACTGGTAGCAATTGCTTCGATCCTCACCACGGGCATCAACTTCCCGCTCCTCGGCCGGAAGTTGTTCGTTCTCTGCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023015
ATGGAAGATATATTGGACTCTACACTCTTACCCCACTTCAGATCACTCTGCGCCATGGCCACTGCTCACAAAATAATCTTCCTCATGGCTGTCTCAGCCGCTGCCTCAGCGGCCGCAGACGACTGCATGAGCTACGACACCGAAGCCGAGGAAGGCAACAAGAGCGAAGCCCTAAAGCTGAAACTGGTAGCAATTGCTTCGATCCTCACCACGGGCATCAACTTCCCGCTCCTCGGCCGGAAGTTGTTCGTTCTCTGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808535.1
MEDILDSTLLPHFRSLCAMATAHKIIFLMAVSAAASAAADDCMSYDTEAEEGNKSEALKLKLVAIASILTTGINFPLLGRKLFVLCPENDIFLMVKAFASGVVLATGFVHILLDAFRSLTSSCISHTPWAKFPFSGFIAMATAVTKERSSTSWAGNFAQIRELQDSGQWWLAGVGCDSVERESLERTLFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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