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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000957`

染色体: Chr04 坐标: 12674601-12675732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000957`
名称	SmilChr04G000957
描述	uncharacterized SmilChr04G000957
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12674601 - 12675732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023017`
GeneID	`131023017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023017`
原始查询	`SmilChr04G000957`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=27.5; qcov=1.05; evalue=4.13e-37; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.8; qcov=1.07; evalue=6.8e-41; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808537.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808537.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808537.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808537.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12674609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B107,B109
`Chr4:12674619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B104,B112,B113,B122,B123,B20,B32,B34,B39,B84,C26,C28,C47,C48,C61,C63,D1
`Chr4:12674633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B90,B92,B97
`Chr4:12674639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B90,B92,B97
`Chr4:12674642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B90,B92,B97
`Chr4:12674657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B90,B92,B97
`Chr4:12674663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C62
`Chr4:12674664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B56,B96
`Chr4:12674670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B107,C23
`Chr4:12674684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B41,B64,C1,D10
`Chr4:12674690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C62
`Chr4:12674695`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B121,B76,C45,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808537.1

320 aa

160

320

MULE

SWIM

PF10551 MULE 62-134 aa PF04434 SWIM 276-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808537.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	62	134	1.2e-08	35.9	MULE transposase domain
`XP_057808537.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	276	303	7.2e-06	26.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952554.1
ATGGAGATGATATACGGTCGAGTTGATGATTCGTTCCTCCTGCTCCCAAGATATCTGTATGCCCTGAGGGAAGCGAATCCTGGCACCTTGATTGGTTTGGAAGTAGACATAGACTGTCGGTTCAAACATTTGTTTGTTGCTCTTGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTACTTTCACCTTCGACCAGTGATTGTGGTTGACGGCACACACCTGAAGGGAAAAAATAGTGGCATTTTGTTTGTTGCTGTGGCAAAAGACGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023017
ATGGAGATGATATACGGTCGAGTTGATGATTCGTTCCTCCTGCTCCCAAGATATCTGTATGCCCTGAGGGAAGCGAATCCTGGCACCTTGATTGGTTTGGAAGTAGACATAGACTGTCGGTTCAAACATTTGTTTGTTGCTCTTGCGGCTTCCATCTCACCTTTCTACTTTCACCTTCGACCAGTGATTGTGGTTGACGGCACACACCTGAAGGGAAAAAATAGTGGCATTTTGTTTGTTGCTGTGGCAAAAGACGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808537.1
MEMIYGRVDDSFLLLPRYLYALREANPGTLIGLEVDIDCRFKHLFVALAASISPFYFHLRPVIVVDGTHLKGKNSGILFVAVAKDGNEAVFPLAIGVGPIENDESWKWFMSHLRQAFGEPENLLIIKGYRPGVAELLCQAAYAYEQSNYTRAMSAMAALKPKAYEKLLRVGPEKWARSQCPVSRYSFLTSNAAKSFNARLLWARCLPICSMLEAIRLVIEQWFNDRLAAAQESDENLTPEAKQKLSAELVKSRRYTAKRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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