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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000961`

染色体: Chr04 坐标: 12792148-12793122 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000961`
名称	SmilChr04G000961
描述	uncharacterized SmilChr04G000961
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12792148 - 12793122 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023020`
GeneID	`131023020`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023020`
原始查询	`SmilChr04G000961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0158600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0158600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=28.3; qcov=0.534; evalue=3.6e-08; confidence=low
Rice	`Os03g0158600` - identity=33.8; qcov=0.41; evalue=1.64e-12; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023020

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808539.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808539.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057808539.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057808539.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12792189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A2,A3,A4,B10,B101,B107,B108,B121,B127,B128,B129,B14,B15,B21,B24,B26,B29,B3,B30,B37,B40,B56,B61,B64,B72,B74,B77,B85,B86,B89,B90,B91,B92,B96,B97,B99,C10,C13,C15,C20,C23,C29,C4,C42,C49,C50,C57,C61,C71,C72,C73,C87,D1,D11,D7
`Chr4:12792241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C29,C75,C84
`Chr4:12792253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:12792357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C18
`Chr4:12792367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:12792420`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr4:12792420`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr4:12792457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B36,B46,D3
`Chr4:12792461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B131,B41,C1,C20
`Chr4:12792495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B42,B43,D4
`Chr4:12792536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B108,C36
`Chr4:12792536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808539.1

324 aa

162

324

RVT_3

PF13456 RVT_3 172-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808539.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	172	291	9.1e-16	58.6	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952556.1
ATGCCGACGTACGATAGGCTAATTAAGCATGGCTTGATTATACCGAACTGGTTCATTTTTTGTCAAAGGGATGCTGAAACGCCGGATCATATCTTCTGGAACTGTGATTCGGTGCGACCCAGTTGGCATACTTTCTGCATTTGGTTTGGTTTTCCGGAAGCTTTGAGTTCTGCTGACATTAATAGTTTTTTGGTTCTTGCTTGGGATCGTAAGATGAGCACTCAAGTCAGTAAGTACTGGAAGGCTGGTATTATTGCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023020
ATGCCGACGTACGATAGGCTAATTAAGCATGGCTTGATTATACCGAACTGGTTCATTTTTTGTCAAAGGGATGCTGAAACGCCGGATCATATCTTCTGGAACTGTGATTCGGTGCGACCCAGTTGGCATACTTTCTGCATTTGGTTTGGTTTTCCGGAAGCTTTGAGTTCTGCTGACATTAATAGTTTTTTGGTTCTTGCTTGGGATCGTAAGATGAGCACTCAAGTCAGTAAGTACTGGAAGGCTGGTATTATTGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808539.1
MPTYDRLIKHGLIIPNWFIFCQRDAETPDHIFWNCDSVRPSWHTFCIWFGFPEALSSADINSFLVLAWDRKMSTQVSKYWKAGIIAMIWAIWNQRNKCIFDNYKFCQRRLLHLVRVAFMEMEMNFKKLGHMDNSWEDYMVLRNIGIKGRAAPPPTFISVSWWPPTAPWMKVNTDGSALGAPGALSYGGVFRDHWGWVRGCFHYKHSMGYAFEAELLAVITAFRIARARNWNNLWIESDSTYVVGLLRKRSEDVPWRFKAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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