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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000966`

染色体: Chr04 坐标: 12961249-12964204 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000966`
名称	SmilChr04G000966
描述	WEB family protein At2g38370
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	12961249 - 12964204 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022777`
GeneID	`131022777`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022777`
原始查询	`SmilChr04G000966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WEB family protein At2g38370
产物	WEB family protein At2g38370
Arabidopsis	`AT2G38370` (AT2G38370) weak chloroplast movement under blue light protein (DUF827) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818418] identity=43.4; qcov=0.98; evalue=1.38e-91; confidence=medium
Rice	`Os03g0339700` - identity=46.1; qcov=0.982; evalue=1.97e-104; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05701 (WEMBL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022777

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057808282.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057808283.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057808282.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808282.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:12961583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:12961621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B54
`Chr4:12962645`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B56,B96
`Chr4:12962645`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:12962817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:12962824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:12962883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:12963074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B18,B52,B79
`Chr4:12963090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:12963095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B54
`Chr4:12963100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:12963277`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A9,B111,B12,B55,B60,B77,C72,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808282.1

553 aa

276

553

WEMBL

PF05701 WEMBL 19-116 aa PF05701 WEMBL 166-416 aa

XP_057808283.1

499 aa

250

499

WEMBL

PF05701 WEMBL 112-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808282.1`	Pfam	`PF05701`	WEMBL	Coiled-coil	19	116	1.6e-58	199.6	Weak chloroplast movement under blue light
`XP_057808282.1`	Pfam	`PF05701`	WEMBL	Coiled-coil	166	416	1.6e-58	199.6	Weak chloroplast movement under blue light
`XP_057808283.1`	Pfam	`PF05701`	WEMBL	Coiled-coil	112	362	3.4e-44	152.3	Weak chloroplast movement under blue light

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952299.1
ACATTCTTTGTTTATTGTGAGAAGTGACAAATCTTGCTCACCTAGGTAATCCAAGTTCAAATAAATAAGGAATTGTATTTATGCCTTTATATGGGAAGAATCCAAACGTTATGGTGATTATAATAGTATTGTGTTAGGACACACCATCACCAAACCCAACACCACTCTAACGTTATTCTCTTTTCTCAGTCGTGCCGTACTTGAAGCTCTTGAAAACACACACACACACACACACTGCCTAATCTCGCCTCCCCACCACA...

XM_057952300.1
TATTCTGAGATATACTAGTGTATATGGGAGCTCAGATTCAAGATTTCCCTATTTTGATGAAGTTCTTGAGATGGCTTCTTTCTGGATGATGGATCTTGTCTTGATTCATATTTTACAATTACATCGATGTAATAAAATAAATGAATGCATCCATATTTTGTCACTATTAACATCACTGCAAAGTTGAGGCCCTTTCCACTTTTTCCATCTTCAAAGTAATATTAATTTGCATCACCAACTGCAACTGCAGAACGTGCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022777
ATGGCCACTGAAAATCCCCAGATTCTGGAAGCCCACCCGCTTGATTCGGGCCGGGCCGAGATCGACACTTCGGCGCCGTTCGAGTCGGTCAAGGAGGCCGCCAACCGCTTCGGCGGCATGGGTTTCTGGAAACCCGTTTCCCACAAGTCTTCTCAACTTTGCGAGCATGAGAGAGAAGTGGCTGTTGATGTTGTCAATTTGGAGGAACAAACTGCACAACTCGAAAGAGATCTCATAGTGAAGGAGAGAGAGACGCTAGA...

LOC131022777
ATGCATGAGAGAGAAGTGGCTGTTGATGTTGTCAATTTGGAGGAACAAACTGCACAACTCGAAAGAGATCTCATAGTGAAGGAGAGAGAGACGCTAGATGTCTTGAAGGAGCTCGAAACGACCAAGAACATCGTTGAGGAATTGAAGTTGAAGCTGCAGAATGAAGCATCCGAGATCAGTGCAGCACTCAAATCAGAATCAACGAGCGATGCCAAGAATCGAGCTGCTGCTGAGGTAGCCGAAGATGGTGGAAGAGATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808282.1
MATENPQILEAHPLDSGRAEIDTSAPFESVKEAANRFGGMGFWKPVSHKSSQLCEHEREVAVDVVNLEEQTAQLERDLIVKERETLDVLKELETTKNIVEELKLKLQNEASEISAALKSESTSDAKNRAAAEVAEDGGRDGKGEKVERVGGVDLCPSEAPGFILLELKQAKLNLTKTTTDLADIRATVDAYNKRIERERASLERTRQRLSSNTSRISCLESELNQKRQKLEEVKDGEVRDPINITRELQKLSSETEQFKK...

XP_057808283.1
MHEREVAVDVVNLEEQTAQLERDLIVKERETLDVLKELETTKNIVEELKLKLQNEASEISAALKSESTSDAKNRAAAEVAEDGGRDGKGEKVERVGGVDLCPSEAPGFILLELKQAKLNLTKTTTDLADIRATVDAYNKRIERERASLERTRQRLSSNTSRISCLESELNQKRQKLEEVKDGEVRDPINITRELQKLSSETEQFKKVGEAARAQVQRALSEIEQTKARIRTAEIRLIAAKKMKAAARASEAVAFAEMKAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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