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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000972`

染色体: Chr04 坐标: 13041218-13043962 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000972`
名称	SmilChr04G000972
描述	uncharacterized SmilChr04G000972
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13041218 - 13043962 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023026`
GeneID	`131023026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023026`
原始查询	`SmilChr04G000972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808545.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057808545.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808545.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808545.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13041221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B75
`Chr4:13042010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:13042013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:13042034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr4:13042044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A6,B2,D10
`Chr4:13042047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr4:13042079`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A2,B106,B11,B112,B120,B13,B15,B17,B35,B5,B56,B58,B67,B81,B83,B94,B96,B99,C11,C19,C21,C26,C29,C41,C49,C52,C53,C57,C69
`Chr4:13042082`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A2,B112,B120,B13,B15,B17,B35,B5,B56,B58,B67,B83,B94,B96,B99,C11,C19,C21,C26,C29,C41,C52,C53,C57,C69
`Chr4:13042084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B84,D8
`Chr4:13042109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:13042113`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	44	A10,A18,A19,A20,A22,A7,B10,B101,B11,B117,B124,B132,B140,B24,B29,B33,B37,B46,B57,B66,B69,B82,B83,B85,B86,B95,C14,C20,C24,C27,C31,C37,C49,C51,C54,C64,C66,C7,C70,C71,C8,C86,D11,D2
`Chr4:13042129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B108,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808545.1

608 aa

304

608

DUF1985

PF09331 DUF1985 85-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808545.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	85	216	1.1e-12	48.9	Domain of unknown function (DUF1985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952562.1
ATGGCTTCTTCTTCAAACCAAGTCCCTTATTCGAGGCCCGAGTCGATCAATCGTCCAACAGTTGAGATCAGTACGTACTACAATATTAAGTACCTGTCGACAGTAGTCCTGAGACTAAACGAAATTGGCGATTTTGCACTGGAGAATACGTTCTGGCAGGGGTGCTTTGGGATGATGTTGGATTGGCAGCCGGGCCAGAAGTGCAATGTTGCATTGCACCATATTGTCTATCGTCATCTTAAGATGACGAGAGACGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023026
ATGGCTTCTTCTTCAAACCAAGTCCCTTATTCGAGGCCCGAGTCGATCAATCGTCCAACAGTTGAGATCAGTACGTACTACAATATTAAGTACCTGTCGACAGTAGTCCTGAGACTAAACGAAATTGGCGATTTTGCACTGGAGAATACGTTCTGGCAGGGGTGCTTTGGGATGATGTTGGATTGGCAGCCGGGCCAGAAGTGCAATGTTGCATTGCACCATATTGTCTATCGTCATCTTAAGATGACGAGAGACGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808545.1
MASSSNQVPYSRPESINRPTVEISTYYNIKYLSTVVLRLNEIGDFALENTFWQGCFGMMLDWQPGQKCNVALHHIVYRHLKMTRDDEDDEICFYINGRKVDFTPRDFALVTGLAFGDDPFDPEAEHDLSEARTFIQFCRGKHVSVQGLADIYFDTASRVVDPDGGFYLRVAHLLVLHAFVLGVDVRRPVQSWTWALVDDLTAFSRFPWGSCAYRSLNYKMKNTTIKKDRTKYHFYGPSWALFIWGLEKIPDLAATIAICN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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