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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000975`

染色体: Chr04 坐标: 13078300-13079759 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000975`
名称	SmilChr04G000975
描述	transcription repressor OFP1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13078300 - 13079759 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022784`
GeneID	`131022784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022784`
原始查询	`SmilChr04G000975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP1-like
产物	transcription repressor OFP1-like
Arabidopsis	`AT2G30400` (OFP2) ovate family protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817591] identity=35; qcov=1.02; evalue=2.78e-40; confidence=low
Rice	`Os01g0823500` (OsOFP4) - identity=31.4; qcov=1.21; evalue=1.83e-35; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate); PF13724 (DNA_binding_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808291.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808291.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808291.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808291.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13078635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B82
`Chr4:13078873`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr4:13078873`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:13078906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:13078915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B115,B58,B78
`Chr4:13078984`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr4:13078984`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr4:13078990`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C26
`Chr4:13078990`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C26
`Chr4:13078992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr4:13078999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:13079113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B58,B59,B63,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808291.1

335 aa

168

335

DNA_binding_2

Ovate

PF13724 DNA_binding_2 1-38 aa PF04844 Ovate 273-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808291.1`	Pfam	`PF13724`	DNA_binding_2	Domain	1	38	7.7e-17	62.0	DNA-binding domain
`XP_057808291.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	273	328	2e-25	89.3	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952308.1
CTTTAAAAAATATTCACTATAAAATAAATATAAAAAAATAAAGATTTAGACAGGGCCTCTTTGCTTTTTGACACAGAATTTCTTCATGTGTGGACCCCACACCATAACCTTTTCTATTTATCCATCATCTTCCCTCACAATCACGCACACTCACAAACAACTCTAGCTACTTATCTCCCAAAATTTTCCCATTAACATTCCATTTCCCACACCTAAATCTATCATTTATAAGAAATAGAAAAAAATGGGTAATTACAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022784
ATGGGTAATTACAAATTCAGATTCTCCGACATGATCCCCAACGCCTGGTTCCACAAGCTCAAGAACATGAACAAGCCCACGCCCAACTACACCAAAACCTTAAACCACTCGAAGAAGAAAATTCCTGCACCGGAATTCACCAACTCCGACCAGCGCAAGTCTTACTACTTCACTAGGGACCTCACTCTCCAACCGGATTCCCCGACCAAGCCCCCCACCGCCGCCGAGCCGCCACGGAGGTCGTCGCGGAGGAGGCGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808291.1
MGNYKFRFSDMIPNAWFHKLKNMNKPTPNYTKTLNHSKKKIPAPEFTNSDQRKSYYFTRDLTLQPDSPTKPPTAAEPPRRSSRRRRSNKRSRAPRPPPRLVSSTISAGCTCGAAVESVWARTQTDSSSQEECTNSGPDQSSSSEPDSILTEYGSGPDSSMLVSWPSPCIKCGTTTNDIVIDVISGVKGGSGGAEEDQCRRLPRIITRKSDDIPTAAAATISPARRIPAKPPGMKLRVNSPRIVGRRRSVSSNSSSAASSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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