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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000980`

染色体: Chr04 坐标: 13213520-13215592 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000980`
名称	SmilChr04G000980
描述	uncharacterized SmilChr04G000980
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13213520 - 13215592 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020089`
GeneID	`131020089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020089`
原始查询	`SmilChr04G000980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818432]; symbol=AT2G38500; hit=AT2G38500; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818432]; symbol=AT2G38500; hit=AT2G38500; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G38500` (AT2G38500) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818432] identity=36.1; qcov=0.984; evalue=7.22e-48; confidence=medium
Rice	`Os01g0823400` - identity=25.9; qcov=1.11; evalue=3.6e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804728.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804728.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804728.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804728.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13213755`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B113
`Chr4:13213755`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B113
`Chr4:13213763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:13213793`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B109,B114,B34,C12,C4
`Chr4:13213793`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B109,B114,B34,C12,C4
`Chr4:13214049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:13214098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B124,B82
`Chr4:13214100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B82
`Chr4:13214273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:13214992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:13215044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A14,A19,A6,B117,B136,B45,B7,B72,B75,B80,B83,B97,C20,C28,C3,C38,C40,C6,C81
`Chr4:13215104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948745.1
GTGATTGAGAATTATTTGATCGTCCTTCTGCAAGAAAAGGGTAAAATTATTATAGAATCAAATTGAATTCGGAAATAATAAATGGTACAAGTAGTGCAATGCATGCCATAGAACGTGCATCTTACGACTTGTACGTACGTGCACCGCACCACGGCCATGCACTTTAAACACCCCCAAAATTCTCGCGGCCAACGCTTACCCCTCTTCCAATGGCGGAAAGAATTCCGCCGCCTATCCCCACCGCCAAAGGCGTTCGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020089
ATGGCGGAAAGAATTCCGCCGCCTATCCCCACCGCCAAAGGCGTTCGATCCGCGGCGGATCCGATCCTATCCGAACAAATAGACCGATCCGCTGCTCAGATCCCCGAGCTGAAACTTCCTCAACACGTCGCTCTATCCAAACCAGACGAAATCAGCTACGAATCGCTTGTGTCGAGGGAAGATGAATCGGTGCGAGGATTATTGAGATCGGTGAGGGATTTCGGAGCAGTTGGAATCAGCGATCACGGAATTCCAACGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804728.1
MAERIPPPIPTAKGVRSAADPILSEQIDRSAAQIPELKLPQHVALSKPDEISYESLVSREDESVRGLLRSVRDFGAVGISDHGIPTEELRFALGNYSDRIFTVEYRTSYGDHEQIEWGGDDRRIAEEAAAAIGEQNYQIFRQKMDNAAIKLEAIAKELADVIAQSGINQYHETIKFGESKFSIQRYNRTNRNSSSVSSETRQESEPYALSLHLFLESGEFRLKHDLSLVSFETKPESLIVTTGKQIEEWSVGEIKSAEGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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