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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000984`

染色体: Chr04 坐标: 13312893-13392871 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000984`
名称	SmilChr04G000984
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13312893 - 13392871 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023031`
GeneID	`131023031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023031`
原始查询	`SmilChr04G000984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 2-like
产物	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT5G45160` (RL2) Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834552] identity=48.3; qcov=0.96; evalue=9.25e-35; confidence=medium
Rice	`Os12g0604600` - identity=38.8; qcov=0.974; evalue=2.12e-28; confidence=medium
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016320 (endoplasmic reticulum membrane fusion)
KEGG	-
Pfam	PF20428 (Sey1_3HB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808552.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057808552.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808552.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808552.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13331812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:13332130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:13392813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:13392816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:13392821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B16
`Chr4:13392845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	37	A18,A22,B1,B110,B120,B122,B21,B26,B30,B36,B48,B49,B57,B60,B61,B68,B71,B72,B81,B90,B92,B95,C27,C29,C31,C32,C48,C5,C55,C61,C68,C71,C86,D1,D2,D4,D5
`Chr4:13392848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B81,C80
`Chr4:13392848`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B81,C80
`Chr4:13392862`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A3,B104,B115,B124,B21,B41,B43,B58,B59,B63,B66,B76,B78,B82,B95,C39,C49,C50,C79,C80,C81,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808552.1

151 aa

151

Sey1_3HB

PF20428 Sey1_3HB 52-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808552.1`	Pfam	`PF20428`	Sey1_3HB	Domain	52	146	1.2e-11	44.9	Sey1 three-helix bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952569.1
ATGGGGGTTTTCGTGTTGCCCAGCTATGAGTACATGAGAGCTGAGTTTGATCAAGAGGTGGACCAACTCAAACTGCGAATAGTTTCGTCCCATCAAAAAGGGGACAATAATTATCTCCCTACATTAAGAATTTTTATGACAAGTGAAAACATGGGATATGATCAAAGAAAATAAGGACCTCCAAGTTCCACCTTTTAGGGTGATGGTTGCCACAATGCGGTGTGAAGAGATTGTCTTTCGAGAGCTGGGGCTCTTAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023031
ATGATCAAAGAAAATAAGGACCTCCAAGTTCCACCTTTTAGGGTGATGGTTGCCACAATGCGGTGTGAAGAGATTGTCTTTCGAGAGCTGGGGCTCTTAAAATCTAACCAGGCTTGGTTAGAATTACAACAAAATGCAAAAAACTATCTCGTGAAGGACTTCGGTAAAAGAACAAGCTTAATCTTGGATGCATCTCTCTCCAAATATGATGAGGAATCTATGAATTTAGAAGAAAATGTGACAAAGGATAAACGCCATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808552.1
MIKENKDLQVPPFRVMVATMRCEEIVFRELGLLKSNQAWLELQQNAKNYLVKDFGKRTSLILDASLSKYDEESMNLEENVTKDKRHFLMSEALKVVHPAYMHTLGHIRSEALQSFKTQLEKSRINFSKSAVRRGHDSCLLQFTQQMFRCIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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