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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000988`

染色体: Chr04 坐标: 13394082-13417190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000988`
名称	SmilChr04G000988
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13394082 - 13417190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023032`
GeneID	`131023032`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023032`
原始查询	`SmilChr04G000988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 1-like
产物	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT1G72960` (AT1G72960) Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843627] identity=30.6; qcov=1.12; evalue=6.32e-24; confidence=low
Rice	`Os01g0575000` (RHD3) - identity=29.7; qcov=1.12; evalue=2.03e-21; confidence=low
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016320 (endoplasmic reticulum membrane fusion)
KEGG	-
Pfam	PF20428 (Sey1_3HB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023032

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057808553.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808553.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808553.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808553.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13394178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C56
`Chr4:13394178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr4:13394184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:13416443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B82
`Chr4:13416486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D10
`Chr4:13416494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A14,A16,A19,A6,B101,B105,B108,B117,B118,B124,B126,B132,B136,B27,B45,B51,B52,B54,B65,B7,B72,B73,B75,B79,B80,B83,B84,B87,B91,B97,C14,C2,C20,C28,C3,C38,C40,C43,C6,C70,C78,C81,C84,C9,D11,D2,D4,D9
`Chr4:13416631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:13417148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:13417185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	122	A13,A14,A16,A18,A22,A4,A6,A9,B1,B101,B102,B105,B108,B110,B112,B114,B117,B118,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B131,B132,B136,B19,B21,B26,B27,B30,B36,B38,B39,B40,B42,B43,B45,B48,B49,B51,B52,B54,B57,B60,B61,B62,B65,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B87,B88,B90,B91,B92,B95,B97,B98,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C35,C36,C38,C40,C41,C43,C45,C46,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C6,C61,C65,C68,C70,C71,C73,C74,C78,C81,C82,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D9
`Chr4:13417190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808553.1

204 aa

102

204

Sey1_3HB

PF20428 Sey1_3HB 2-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808553.1`	Pfam	`PF20428`	Sey1_3HB	Domain	2	195	8e-17	61.9	Sey1 three-helix bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952570.1
TCAGATTATGCTGCCATAAAGCAGGCAGACTGGAAGGATGATGTTTCAACTATGCGCCAAGAACTTCTTCGTGAAATTAAAGAACATGCACTATATCAGCTACGGGAGCAACTTTCAATGAGTCTTACTACAGAAATGGAAATATCAAAAGTTATGGAACATCCAAACGACGTATGGGGTCGTATTAGCAGTGTGATAAAGAGAGAGAGTGAAAGAGCTGAATCCGCCATTGTTGATATATTTGGGGTGGAGAAGGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023032
ATGCGCCAAGAACTTCTTCGTGAAATTAAAGAACATGCACTATATCAGCTACGGGAGCAACTTTCAATGAGTCTTACTACAGAAATGGAAATATCAAAAGTTATGGAACATCCAAACGACGTATGGGGTCGTATTAGCAGTGTGATAAAGAGAGAGAGTGAAAGAGCTGAATCCGCCATTGTTGATATATTTGGGGTGGAGAAGGAAGAAGTTGGTCGAATCATAGCTGATTTAAAGCAACACGCTGCAAACAGGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808553.1
MRQELLREIKEHALYQLREQLSMSLTTEMEISKVMEHPNDVWGRISSVIKRESERAESAIVDIFGVEKEEVGRIIADLKQHAANRVETFFKDESRYVATLMKKRFVFALFASKSPTIKEAYSQCLDILSTMAVIRLDNNHDGVRRLLYSGLMDAHKISPDPLSSITWEKVPSQKTLITPIKCRDIWNKFKLDMELRLANDRLYR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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