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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000995`

染色体: Chr04 坐标: 13780289-13782866 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000995`
名称	SmilChr04G000995
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13780289 - 13782866 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019738`
GeneID	`131019738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019738`
原始查询	`SmilChr04G000995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5-like
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5-like
Arabidopsis	`AT2G40930` (UBP5) ubiquitin-specific protease 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818691] identity=76.4; qcov=0.688; evalue=2.21e-23; confidence=medium
Rice	`Os10g0160000` - identity=72.7; qcov=0.688; evalue=4.68e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057804307.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804307.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804307.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804307.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13780530`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B22,B64,B84,D7,D8
`Chr4:13780530`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B22,B64,B84,D7,D8
`Chr4:13780612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,C13,C18,C2
`Chr4:13782081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B27,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

14 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100410.1
AAGTGATTAAAGTGGAGCTTATTGAAGTGGGTTATATAGAATGAGAACAACAAACAAAATCCTTTGGGAATGCGTGTAATTGTTCTGTTCCTTTTTGAGTGTAAGATTTCTGTACTCAATTTTGTTCAGCAAGTGTTCTGACTATTCTCCTCTTGCAGGAAGAGCTTGCACTCGCATTTGGTGAATTGTTGAGGAAACTCTGGTCTTTTGGTCGAACTCCAATTGCACCTCGTGTATTTAAGGGGAAAGTTGCCCGTTTT...

XR_009100413.1
AAGTGATTAAAGTGGAGCTTATTGAAGTGGGTTATATAGAATGAGAACAACAAACAAAATCCTTTGGGAATGCGTGTAATTGTTCTGTTCCTTTTTGAGTGTAAGATTTCTGTACTCAATTTTGTTCAGCAAGTGTTCTGACTATTCTCCTCTTGCAGGAAGAGCTTGCACTCGCATTTGGTGAATTGTTGAGGAAACTCTGGTCTTTTGGTCGAACTCCAATTGCACCTCGTGTATTTAAGGGGAAAGTTGCCCGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019738
ATGCGTGAAGAGCTTGCACTCGCATTTGGTGAATTGTTGAGGAAACTCTGGTCTTTTGGTCGAACTCCAATTGCACCTCGTGTATTTAAGGGGAAAGTTGCCCGTTTTGCTCCCCAGTTTAGTGGTTATAATCATCATGATTCGCAGGCAAAGCTACAGTGGTTATGGGAACGAGTGGTGCTAGAAAATCAACTATTGGGAAAGATTTTTGTCCAGTTGGGAAACAATATCAGGCTCTGCTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804307.1
MREELALAFGELLRKLWSFGRTPIAPRVFKGKVARFAPQFSGYNHHDSQAKLQWLWERVVLENQLLGKIFVQLGNNIRLC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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