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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000998`

染色体: Chr04 坐标: 13826619-13827179 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000998`
名称	SmilChr04G000998
描述	uncharacterized SmilChr04G000998
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	13826619 - 13827179 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023038`
GeneID	`131023038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023038`
原始查询	`SmilChr04G000998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0104700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0104700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0104700` - identity=29.5; qcov=0.791; evalue=2.56e-10; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808559.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057808559.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808559.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808559.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808559.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:13826649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr4:13826651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr4:13826668`	`GT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A2,B43,C56
`Chr4:13826674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C40
`Chr4:13826679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A20,B64,C72
`Chr4:13826679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B64,C72
`Chr4:13826695`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,A20,B119,B57,B64,B73,B8,C4,C45
`Chr4:13826752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:13826811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:13826897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:13826910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A16,A18,A19,A20,B101,B105,B108,B126,B27,B40,B42,B51,B54,B55,B65,B76,B77,B84,C1,C12,C14,C2,C34,C35,C43,C44,C70,C71,C85,C9,D1,D2,D4,D8,D9
`Chr4:13827009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A3,B76,C1,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808559.1

163 aa

163

SWIM

PF04434 SWIM 114-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808559.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	114	136	8.3e-06	25.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952576.1
ATGGAGCTCACCGACGACTTTCTCAAATTGGACCGGAGAGGTGGGCTAGGTCAAAGTGTCCAGTACAGCGCTATGGATTTTTTTACCTCTAATGCAGCAGAATGTTTGAACTCTCAGTTGTGGTGGGCTAAGCGTTTACCAGTGTGCTCTTTACTTGAATCATTTCGCACACTTTTGGAGGATTGGTTTGACGAGCGACGTACAGCGGCTGAATCCAGAGATCATGTGTTGACGGTGTCTACTTTCAACAAGCTATCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023038
ATGGAGCTCACCGACGACTTTCTCAAATTGGACCGGAGAGGTGGGCTAGGTCAAAGTGTCCAGTACAGCGCTATGGATTTTTTTACCTCTAATGCAGCAGAATGTTTGAACTCTCAGTTGTGGTGGGCTAAGCGTTTACCAGTGTGCTCTTTACTTGAATCATTTCGCACACTTTTGGAGGATTGGTTTGACGAGCGACGTACAGCGGCTGAATCCAGAGATCATGTGTTGACGGTGTCTACTTTCAACAAGCTATCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808559.1
MELTDDFLKLDRRGGLGQSVQYSAMDFFTSNAAECLNSQLWWAKRLPVCSLLESFRTLLEDWFDERRTAAESRDHVLTVSTFNKLSNSVQASLPLTVRATTGLVYKVEEDNQQYQVDLQNWTCDCREFDEDKIPCKQAVAVTRWAGNGLSVYDFDTNISNNMS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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