当前解析结果
SmilChr04G001009| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001009 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001009 |
| 描述 | myosin-7-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 14090632 - 14094009 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019756 |
|---|---|
| GeneID | 131019756 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019756 |
| 原始查询 | SmilChr04G001009 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | myosin-7-like |
| 产物 | myosin-7-like |
| Arabidopsis | AT1G04600 (XIA)myosin XI A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839480] identity=56; qcov=1; evalue=2.29e-23; confidence=medium |
| Rice | Os02g0816900 (OSMYOXIB)- identity=41; qcov=1.04; evalue=7.19e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019756 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057804324.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057804324.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057804324.1 |
| 4 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.20000 | XP_057804324.1 |
| 5 | Spindle | Spindle | 0.20000 | XP_057804324.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:14092202 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B115,B53,B9,C54 |
Chr4:14092202 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B115,B53,B9,C54 |
Chr4:14092230 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B138,B80,B9,C72 |
Chr4:14092491 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B74,C13,C17,C27 |
Chr4:14092510 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 12 | B118,B30,B36,B86,C17,C30,C35,C5,C7,C75,C76,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。