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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001016`

染色体: Chr04 坐标: 14144752-14146774 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001016`
名称	SmilChr04G001016
描述	uncharacterized SmilChr04G001016
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	14144752 - 14146774 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023043`
GeneID	`131023043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023043`
原始查询	`SmilChr04G001016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=37.9; qcov=0.232; evalue=3.16e-19; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808566.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808566.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808566.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808566.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:14144774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C59
`Chr4:14144776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A19,A3,B109,B122,B123,B137,B19,B3,B6,B69,B73,C55,C67,C77,C82
`Chr4:14144786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:14144809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C18,C44
`Chr4:14144812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C27
`Chr4:14144817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B68,C8
`Chr4:14144821`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C60,C82
`Chr4:14144821`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C60,C82
`Chr4:14144832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B107,B60,C85
`Chr4:14144841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B13,B70,B85,C45
`Chr4:14144842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B50
`Chr4:14144842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808566.1

624 aa

312

624

Asp_protease_2

RVT_1

PF13650 Asp_protease_2 207-297 aa PF00078 RVT_1 547-613 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808566.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	207	297	1.6e-06	29.4	Aspartyl protease
`XP_057808566.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	547	613	2.6e-09	37.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952583.1
ATGACAAAGCAGAGCATGGAGTCCCAGTCGGCTACAATCAAGCGTCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAATCAGATGCAGCAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTACATGGACAAGGATTGCAGCCCCACCAAGCCCAAGCAGTTACTGTTTTACGCAATGGGAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCTGTAGAAGAACCTCCCAAAGAAGCCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023043
ATGACAAAGCAGAGCATGGAGTCCCAGTCGGCTACAATCAAGCGTCTCGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAATCAGATGCAGCAGCAGCAACAACCAGGGAAGCTACATGGACAAGGATTGCAGCCCCACCAAGCCCAAGCAGTTACTGTTTTACGCAATGGGAAGGTGGTGAACAACAAAGTGGAAGCCCCTGTAGAAGAACCTCCCAAAGAAGCCCGCATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808566.1
MTKQSMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQMQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRNGKVVNNKVEAPVEEPPKEARMEEQVKEPLQPREEEKEKEKEPEVKLHKAAKPYKPPVPYPSRLKNEKLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYVKFFKELASKKRKFVDNKKILVSEVANSIMQQPLPPKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGDLKPTRMCLQLADRSVRYPRGVIED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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