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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001017`

染色体: Chr04 坐标: 14172161-14173707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001017`
名称	SmilChr04G001017
描述	uncharacterized SmilChr04G001017
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	14172161 - 14173707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023044`
GeneID	`131023044`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023044`
原始查询	`SmilChr04G001017`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=34.9; qcov=0.464; evalue=1.28e-30; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.8; qcov=1.21; evalue=2.54e-45; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023044

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808567.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808567.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808567.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808567.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:14172163`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr4:14172163`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr4:14172185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:14172193`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr4:14172193`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr4:14172201`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A13,A20,B112,B2,B21,B23,B27,B42,B43,B72,B76,B92,C81,D1,D10
`Chr4:14172204`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A13,A20,B112,B2,B21,B23,B27,B42,B43,B72,B76,B92,C81,D1,D10
`Chr4:14172259`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A16,B101,B105,B108,B54,B84,B91,C2,C43,C70,C9,D2,D8
`Chr4:14172283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B76
`Chr4:14172284`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A13,A19,B117,B2,B23,B27,B42,B43,B62,B65,B72,B76,B8,B83,C1,C17,C31,C76,D5
`Chr4:14172285`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A13,A19,B117,B2,B23,B27,B42,B43,B62,B65,B72,B76,B8,B83,C1,C17,C31,C76,D5
`Chr4:14172317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808567.1

427 aa

214

427

RVT_1

PF00078 RVT_1 108-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808567.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	108	220	6.4e-21	75.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952584.1
ATGCTCAAGTACAAAAGGAAGCCTCATATTATTTCGCATCTGGTCATTAACGGAGAGAGTTGTGTTGACCAGAGCGTCATCGGCAGCCACATCGTGGAGTGTTTTTCGACGCTTTTCACCGAGATCACGCAGGCTCCTTTAGATATTATCAACGTGGATGCGGTGTTGGATCACATTATCTCTGATCAGGCTAATGAGATGTTGTCAATCATTCCCGGAGAAGAGGAGATAACAACTGCAGTCTTCCAAATGGATGCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023044
ATGCTCAAGTACAAAAGGAAGCCTCATATTATTTCGCATCTGGTCATTAACGGAGAGAGTTGTGTTGACCAGAGCGTCATCGGCAGCCACATCGTGGAGTGTTTTTCGACGCTTTTCACCGAGATCACGCAGGCTCCTTTAGATATTATCAACGTGGATGCGGTGTTGGATCACATTATCTCTGATCAGGCTAATGAGATGTTGTCAATCATTCCCGGAGAAGAGGAGATAACAACTGCAGTCTTCCAAATGGATGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808567.1
MLKYKRKPHIISHLVINGESCVDQSVIGSHIVECFSTLFTEITQAPLDIINVDAVLDHIISDQANEMLSIIPGEEEITTAVFQMDAVTTFFIKSYLPSGCNANTLILIPKKDTVTTVADLRPIVLSNFLFKIISKVLAARLSVVAAQFVSKNQFGFIRDRSIHDCIVLGSEGFNYLRRSCGGQNMACKVDITKAFNTLRWDFLINVLKVCGYHHRFIRWIEFCRGVPFPTHLLYADDILIFCKATKSNAKTFRKFLDFYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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