当前解析结果
SmilChr04G001028| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001028 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001028 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001028 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 14432855 - 14433892 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023045 |
|---|---|
| GeneID | 131023045 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023045 |
| 原始查询 | SmilChr04G001028 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=35.5; qcov=0.318; evalue=3.68e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023045 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808569.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808569.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808569.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808569.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808569.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:14432866 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B27,C43 |
Chr4:14432894 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,C28,C65 |
Chr4:14432900 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr4:14432903 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr4:14432914 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B110,B2,C1,C42 |
Chr4:14432919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,C8 |
Chr4:14432928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B43,B68 |
Chr4:14432971 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B53,C37,C8 |
Chr4:14432978 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B11,B20,B6,B64,C44 |
Chr4:14432980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B56,B86,B96 |
Chr4:14433007 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,C65 |
Chr4:14433010 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B2,B64,C17,C27 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。