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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001045`

染色体: Chr04 坐标: 14874278-14875512 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001045`
名称	SmilChr04G001045
描述	non-specific lipid-transfer protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	14874278 - 14875512 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019757`
GeneID	`131019757`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019757`
原始查询	`SmilChr04G001045`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid-transfer protein 3-like
产物	non-specific lipid-transfer protein 3-like
Arabidopsis	`AT5G59320` (LTP3) lipid transfer protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836051] identity=50; qcov=1.01; evalue=4.02e-22; confidence=medium
Rice	`Os11g0115350` (LTP2-A) - identity=42.7; qcov=1.01; evalue=4e-18; confidence=low
GO	GO:0006869 (lipid transport); GO:0008289 (lipid binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019757

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804325.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804325.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804325.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804325.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804325.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:14874444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:14874498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804325.1

81 aa

Tryp_alpha_amyl

LTP_2

PF00234 Tryp_alpha_amyl 1-77 aa PF14368 LTP_2 2-67 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804325.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	1	77	4.1e-11	43.7	Protease inhibitor/seed storage/LTP family
`XP_057804325.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	2	67	1e-05	26.3	Probable lipid transfer

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948342.1
TGGTGCTAACGCAGATGCAGCCGTGCAGGAACTACCTGAAGTCGGGCGGCAGCGTCCCGGCCGACTGCTGCAAGGGCGTCAAGACGCTCAACAGCACCGCCACCACGCCGGCCAAGAAGAGGCAATTCTGCGACTGCCTCAAATCTGAGGCCAAATCTCTAGGCGTCAACTCTCAATATGCTTCAAGCTTGCCTAAGAAATGTAGTGTTAACCTTCGATACCCAATCAACTACAACTTTAACTGTTCCAGTATACAGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019757
ATGCAGCCGTGCAGGAACTACCTGAAGTCGGGCGGCAGCGTCCCGGCCGACTGCTGCAAGGGCGTCAAGACGCTCAACAGCACCGCCACCACGCCGGCCAAGAAGAGGCAATTCTGCGACTGCCTCAAATCTGAGGCCAAATCTCTAGGCGTCAACTCTCAATATGCTTCAAGCTTGCCTAAGAAATGTAGTGTTAACCTTCGATACCCAATCAACTACAACTTTAACTGTTCCAGTATACAGTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804325.1
MQPCRNYLKSGGSVPADCCKGVKTLNSTATTPAKKRQFCDCLKSEAKSLGVNSQYASSLPKKCSVNLRYPINYNFNCSSIQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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