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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001067`

染色体: Chr04 坐标: 15278070-15289778 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001067`
名称	SmilChr04G001067
描述	uncharacterized SmilChr04G001067
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15278070 - 15289778 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019817`
GeneID	`131019817`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019817`
原始查询	`SmilChr04G001067`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26133 (DUF8039)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019817

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804405.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804405.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804405.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804405.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15280127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:15280170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:15280239`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A16,B126,B130,B27,B31,B34,B5,B63,B65,B71,B8,B83,B84,B9,B91,B93,C14,C30,C32,C44,C54,C58,C59,C62,C68,C70,C72,C76,C9,D9
`Chr4:15280275`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A11,A18,A8,B1,B108,B109,B111,B112,B120,B21,B23,B25,B26,B52,B67,B73,B74,B80,B9,B95,B97,C14,C23,C28,C38,C44,C48,C61,C78,C8,C83,D2,D5
`Chr4:15280279`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr4:15280279`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B22
`Chr4:15280397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:15280433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B122,B25,B55,C5
`Chr4:15280480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:15280511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B112
`Chr4:15280622`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B114,B120,B123,B124,B127,B138,B139,B14,B36,B41,C60,C75
`Chr4:15280640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B87,C37,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804405.1

261 aa

130

261

DUF8039

PF26133 DUF8039 184-249 aa

XP_057804406.1

261 aa

130

261

DUF8039

PF26133 DUF8039 184-249 aa

XP_057804407.1

261 aa

130

261

DUF8039

PF26133 DUF8039 184-249 aa

XP_057804408.1

261 aa

130

261

DUF8039

PF26133 DUF8039 184-249 aa

XP_057804409.1

261 aa

130

261

DUF8039

PF26133 DUF8039 184-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804405.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	184	249	9.9e-09	36.2	Domain of unknown function (DUF8039)
`XP_057804406.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	184	249	9.9e-09	36.2	Domain of unknown function (DUF8039)
`XP_057804407.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	184	249	9.9e-09	36.2	Domain of unknown function (DUF8039)
`XP_057804408.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	184	249	9.9e-09	36.2	Domain of unknown function (DUF8039)
`XP_057804409.1`	Pfam	`PF26133`	DUF8039	Domain	184	249	9.9e-09	36.2	Domain of unknown function (DUF8039)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948425.1
GACATTCACCCATCTGCACGAACTTCATTCGAAACCCTGTTCCGCGCCATCTCAGAAAAAAGCACGGGCAGGCGCCCTATTTCTCTCACTGTTATATTCAATTTTCAATTCGTTCGGAACCCTCGCCCGACCATCCCAGTTGAAGCAATTCCCCGCTGCCTCATCTGCGTAAAAATCAGTCGCCACCGCAGCCTCGTGGACTCCGGCGTCGACGTCGTCTTCAGCATCGCCGGCACGCCCTTTTCGAAAGGATTCATCTT...

XM_057948426.1
CCCATCTGCACGAACTTCATTCGAAACCCTGTTCCGCGCCATCTCAGAAAAAAGCACGGGCAGGCGCCCTATTTCTCTCACTGTTATATTCAATTTTCAATTCGTTCGGAACCCTCGCCCGACCATCCCAGTTGAAGCAATTCCCCGCTGCCTCATCTGCGTAAAAATCAGTCGCCACCGCAGCCTCGTGGACTCCGGCGTCGACGTCGTCTTCAGCATCGCCGGCACGCCCTTTTCGAAAGGATTCATCTTCTTTGCTG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131019817
ATGAAGGATGAGTTACTTGGTGATGAGAACATTGATAGAGCTATAATGTGGAAGAAAGCTAGATTGAAAAAAGATGGGAGCGTAGAGAATGAAGACTTGAAGAAAGTTGTTGAAAAAATTGATGAACGTCTACGTGAAAAGGAGCAAGGAGATTCGACTAAGGTAGATGATGGTAAGGAGGATCTTCTAACTTCTATATTGAAGAAGTCAGAACACTCGGGGCGTGTGCAAGCTGTTGGGGATAATGTATATCCCACTGC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057804405.1
MKDELLGDENIDRAIMWKKARLKKDGSVENEDLKKVVEKIDERLREKEQGDSTKVDDGKEDLLTSILKKSEHSGRVQAVGDNVYPTAFFNLPKEKRQKLDEKVDKQELIEARHEWKNMMGELLSRIGNLESTLKARDKLSVEKGSCSVKYPHDPIEYEKDDDGDDDDVVCIDSEDIFEGKYVALKKKGTRATLAYGTVIVAGPMLHGAPMPKNARRVSVDEVVADNENELLPYPVSEEILTVGSGIGNTCSMAERIDGRK...

XP_057804406.1
MKDELLGDENIDRAIMWKKARLKKDGSVENEDLKKVVEKIDERLREKEQGDSTKVDDGKEDLLTSILKKSEHSGRVQAVGDNVYPTAFFNLPKEKRQKLDEKVDKQELIEARHEWKNMMGELLSRIGNLESTLKARDKLSVEKGSCSVKYPHDPIEYEKDDDGDDDDVVCIDSEDIFEGKYVALKKKGTRATLAYGTVIVAGPMLHGAPMPKNARRVSVDEVVADNENELLPYPVSEEILTVGSGIGNTCSMAERIDGRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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