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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001074`

染色体: Chr04 坐标: 15422673-15426627 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001074`
名称	SmilChr04G001074
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g08570
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15422673 - 15426627 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019798`
GeneID	`131019798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019798`
原始查询	`SmilChr04G001074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At3g08570
产物	BTB/POZ domain-containing protein At3g08570
Arabidopsis	`AT3G08570` (AT3G08570) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820004] identity=62.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0117600` - identity=59.7; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804365.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804366.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804365.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804365.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15424561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:15425024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:15425045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:15425514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C18,C2,C35
`Chr4:15425776`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A7,B109,B11,B114,B124,B129,B34,B46,B97,C12,C26,C4,D6
`Chr4:15425807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15425902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:15426238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15426347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C84
`Chr4:15426557`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A10,B131,B134,B14,B28,B55,B65,B77,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804365.1

616 aa

308

616

BTB

NPH3

PF00651 BTB 54-138 aa PF03000 NPH3 213-476 aa

XP_057804366.1

591 aa

296

591

BTB

NPH3

PF00651 BTB 29-113 aa PF03000 NPH3 188-451 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804365.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	54	138	2.1e-05	25.4	BTB/POZ domain
`XP_057804365.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	213	476	2.4e-87	293.5	NPH3 family
`XP_057804366.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	29	113	1.9e-05	25.5	BTB/POZ domain
`XP_057804366.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	188	451	2.2e-87	293.7	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948382.1
CCATCCCCCTTCATTATGCAGCACGCAGCTCGGATTTCTGGTGTTAGGAAGAGGGTTAAATCGTTAAATAGTGTGTTGAAGTCCATACAAAGGCGAATTGACAATATGGACCGGATGTTGTCAGCTGGATTAGCTCATGGTGCAGAAACAACGGGGGGAGAAAGCAGTGAGCAGCAGCATGCTCAATAACGAAGTCATTCAACGGCCAAGAATGGTGTGGGATCAGCCTCTCTCCGCCGCCACTCCCAAATTCTCCACCA...

XM_057948383.1
GCTCCTTCTCCGAATCCTAATTAATTAAAAAAAGTGAAGATCTGAAAAATAAGCAATGACGAAAGTGAAAAACTAAAGACAACTCCATCCCACAAGAAAGAGACAAAGGAATGAAAAGCAAAAGGTGCATCTGCGTAAAGAGCAAAAGTCATTCAACGGCCAAGAATGGTGTGGGATCAGCCTCTCTCCGCCGCCACTCCCAAATTCTCCACCACCTTCGCCAACCGCATTTTCTCTGATGTTGCTGGGGACATCACAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019798
ATGGTGCAGAAACAACGGGGGGAGAAAGCAGTGAGCAGCAGCATGCTCAATAACGAAGTCATTCAACGGCCAAGAATGGTGTGGGATCAGCCTCTCTCCGCCGCCACTCCCAAATTCTCCACCACCTTCGCCAACCGCATTTTCTCTGATGTTGCTGGGGACATCACAATCATTGTTGATGGAGAATCCTTCCTACTGCATAAGTTCCCCCTCGTAGCTCGAAGTGGAAAGATCCGCAAGCTCGTTGCCGATGCCAAGAA...

LOC131019798
ATGGTGTGGGATCAGCCTCTCTCCGCCGCCACTCCCAAATTCTCCACCACCTTCGCCAACCGCATTTTCTCTGATGTTGCTGGGGACATCACAATCATTGTTGATGGAGAATCCTTCCTACTGCATAAGTTCCCCCTCGTAGCTCGAAGTGGAAAGATCCGCAAGCTCGTTGCCGATGCCAAGAACACGGGCCTGTCGAAGCTCGAACTCACCAACCTCCCCGGAGGCCCCGAGATGTTTGAACTCGCTGCCAAATTCTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804365.1
MVQKQRGEKAVSSSMLNNEVIQRPRMVWDQPLSAATPKFSTTFANRIFSDVAGDITIIVDGESFLLHKFPLVARSGKIRKLVADAKNTGLSKLELTNLPGGPEMFELAAKFCYCMNFVITTANVAPLRCAAEYLEMTEDYQDENLIDRTQTYLTQVVCPSLEKSVQVLSACKTLLPLAEEIGITERCITAIAMNACKEQLVSRLDDCRGDVKEWWVEDLSGLGISFYRRVVIAMGQSGVRGDSIVASLMHYAQTSLKGIG...

XP_057804366.1
MVWDQPLSAATPKFSTTFANRIFSDVAGDITIIVDGESFLLHKFPLVARSGKIRKLVADAKNTGLSKLELTNLPGGPEMFELAAKFCYCMNFVITTANVAPLRCAAEYLEMTEDYQDENLIDRTQTYLTQVVCPSLEKSVQVLSACKTLLPLAEEIGITERCITAIAMNACKEQLVSRLDDCRGDVKEWWVEDLSGLGISFYRRVVIAMGQSGVRGDSIVASLMHYAQTSLKGIGKPQIWNPARATTPSLSLIESGQRAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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