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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001079`

染色体: Chr04 坐标: 15470125-15473921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001079`
名称	SmilChr04G001079
描述	uncharacterized SmilChr04G001079
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15470125 - 15473921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019799`
GeneID	`131019799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019799`
原始查询	`SmilChr04G001079`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine repetitive matrix-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820014]; symbol=AT3G08670; hit=AT3G08670; species=arabidopsis; confidence=high
产物	serine/arginine repetitive matrix-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820014]; symbol=AT3G08670; hit=AT3G08670; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G08670` (AT3G08670) serine/arginine repetitive matrix-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820014] identity=57.1; qcov=1.07; evalue=8.09e-154; confidence=high
Rice	`Os05g0480600` - identity=39.5; qcov=1.1; evalue=2.87e-82; confidence=medium
GO	GO:0043622 (cortical microtubule organization); GO:0055028 (cortical microtubule)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057804367.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804367.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804367.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804367.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804367.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15470771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:15470792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:15470883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15471252`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A9,B102,B111,B12,B4,B55,B60,B77,B98,C20,C5,C72,D7,D8
`Chr4:15472111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15472562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15472645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C2
`Chr4:15472865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C35
`Chr4:15472870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15472907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15472950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:15473021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948384.1
TTTCCACTTGCAAATTTCATGTTACTTCCTCAATCTTATACAATCAAGAATGAATTATGAGCAACATTTTCGATTATTCAAGGGGGTCTTCATTCTTCAACACGGTCAACACTGAATTTATGTGTAGAAGCAAAATTAATGTTGGTGTATATGGATGTACACCTAAAATTTTGAAAATTTCGAGGTATACACATGACATACGAATACTAAATTTAATAAGGAGAGTCAATTTAAGAGCAAGATCTCATGAGAGTAGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019799
ATGAATCGGACCTTGAGAGAATCCGTCATCGGCGCCGGCCGCAACCACCGCCGAGGCCACAGCATCAATGGAGTCCCCAATTCCAGGGATTCCACCGACGACAATCTAGATCTCTTCTCCAAAAGCCGCCGCAGCCTCTCCGTCGCCCCTTCCGACGAGCCAGATGTGCCGTTGAAATTGGGGAGGCTTTCGCTTGGATCCGCGAAACCGGGGAGGACTGGATTAGATGATTTATTGTCATCGGGTGATGGAGGGAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804367.1
MNRTLRESVIGAGRNHRRGHSINGVPNSRDSTDDNLDLFSKSRRSLSVAPSDEPDVPLKLGRLSLGSAKPGRTGLDDLLSSGDGGKHDYDWLLTPPGTPLVPSFDGNESQAGLMAPRSGPLVRSISTAKASRLSVSHSENNHVAKPTRSSSVTRPSISTSQYSTYSNKSTSILNTSSASVSSYIRPSTPTNRPSSRPSTPSARQTASRSSTPSKPRPTHSTSSIDKPRATQNSRPSTPTSRPQLSTTLNSPAPRTTSRPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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