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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001080`

染色体: Chr04 坐标: 15484558-15486384 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001080`
名称	SmilChr04G001080
描述	uncharacterized SmilChr04G001080
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15484558 - 15486384 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019808`
GeneID	`131019808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019808`
原始查询	`SmilChr04G001080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804384.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804384.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057804384.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804384.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804384.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15485120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr4:15485204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C18,C35
`Chr4:15485204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C35
`Chr4:15485221`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	139	A11,A13,A15,A18,A24,A4,A5,A6,A9,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B115,B118,B119,B12,B121,B127,B129,B13,B130,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B140,B15,B17,B19,B21,B24,B26,B27,B29,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B60,B61,B62,B64,B68,B72,B76,B77,B78,B80,B85,B86,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C12,C13,C14,C17,C19,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C40,C42,C43,C45,C46,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C60,C63,C64,C66,C70,C71,C72,C73,C74,C77,C8,C83,C86,D1,D4,D7,D8
`Chr4:15485222`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	113	A11,A13,A15,A18,A24,A5,A6,A9,B100,B101,B102,B105,B106,B108,B11,B111,B12,B121,B127,B129,B13,B133,B134,B137,B138,B139,B140,B15,B17,B19,B21,B24,B26,B27,B29,B32,B33,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B52,B53,B55,B57,B60,B61,B64,B68,B72,B76,B77,B80,B85,B86,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B95,B98,C10,C12,C13,C14,C17,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C40,C42,C43,C45,C49,C5,C50,C55,C56,C60,C64,C66,C70,C71,C72,C73,C74,C77,C8,C86,D1,D4,D7
`Chr4:15485275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15485296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15485314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15485439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:15485602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:15485610`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A23,A8,B113,B2,B20,B49,B66,B79,B89,B99,C10,C60,C76
`Chr4:15485628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948401.1
AATCTCACTGCTACAGTATGCGATTTTAATTATCAGTTTTTCAAATCTGCCCTTTTTCAAATTAAAAAAAACAAATAAAAAATTAGAGAGGGCAAATCTGCTCTTGGTTCTTCATTCTGAACAGCCGCCGCCAAACATCAACTTTTCGATCTTGTTTCACAACAGCCGAGTCCCGTCATCTTCCTGCAAATTCCCGTCGATCCAAACACAGAAAGCGAAGAAGAATTTTGTGTTTCAGAGGTTTACGGCGGTTTTGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019808
ATGGATATTCAAACATCACCATCGTTTTTAACGCGAGGAGGAGTGTTTAGAGCGGGGATCGACGACGGTTTGGGATTGAAAGCTTGCGAATTATGGCCATCTCTCTCCAGATCTCCATCTCGTCGTATCTGTCTCATAGTGGCTGTCAACTTTGAACCTTGGATTTATATCTTGGACGTAGGCGGCGGCAGATGCGACGGCGATCGTGTCGAGCAACGCCCTAATCTTCGAATCCCGAAGAGCTTCAGTTTTACTTGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804384.1
MDIQTSPSFLTRGGVFRAGIDDGLGLKACELWPSLSRSPSRRICLIVAVNFEPWIYILDVGGGRCDGDRVEQRPNLRIPKSFSFTCFCVVDSILYAVNEDDVYSFRLSDKLSDVVLEDNMLEKLPILLNPKEDALPVQFGNCVLFFSTQIQFHETVDSPIRKLTCDFELYDPIHNVHTKLPQLWIRRPNTSRTCQTFQFLRPNSTWADFRISKIGIRSNSFTIESYAFNGTKFLVQTSFGRLFSIDLFDPSLAEWQLVDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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