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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001085`

染色体: Chr04 坐标: 15563198-15572536 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001085`
名称	SmilChr04G001085
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	15563198 - 15572536 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019825`
GeneID	`131019825`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019825`
原始查询	`SmilChr04G001085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
Arabidopsis	`AT1G64230` (UBC28) ubiquitin-conjugating enzyme 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842728] identity=85.2; qcov=1; evalue=1.76e-90; confidence=high
Rice	`Os02g0261100` (UBC5B) - identity=84.6; qcov=1; evalue=1.3e-89; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019825

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057804421.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804423.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057804423.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057804423.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:15563237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B30,B40,B67,B81,C16,C6,C62,D3,D7
`Chr4:15569828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C73
`Chr4:15569848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B114
`Chr4:15569848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:15571339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:15571359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B10,B107,B130,C39,C53,C75,C87
`Chr4:15571421`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B104,B89,C80
`Chr4:15571421`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B104,B89,C80
`Chr4:15571436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B81,C6
`Chr4:15571948`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B50,C14,C42
`Chr4:15571948`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B50,C14,C42
`Chr4:15571950`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A15,B69,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804421.1

181 aa

181

UQ_con

PF00179 UQ_con 63-180 aa

XP_057804422.1

154 aa

154

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-153 aa

XP_057804423.1

149 aa

149

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-148 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804421.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	63	180	1.3e-45	155.2	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057804422.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	153	2.4e-44	151.1	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057804423.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	148	5.3e-47	159.7	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948438.1
ATGGCTTCAAAGCGTATTTTGAAGGAACTCAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGCAGTGCCGCTAGTAAATCTACTTTCTTATTAGCCTTGTGTCAATTAAAAGACTGTTGTCGGTTATGTATTTTGCTCCTAACCGCTTTGTTTTCTTACCATCTAGGATGGATTCTACTTGTTGCAAGACCTGTTGTTAAAGATATGTTTCACTGGCAAGCAACCATCATGGGACCCACAGACAGTCTGTATTCTAGAGA...

XM_057948439.1
ATGGCTTCAAAGCGTATTTTGAAGGAACTCAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGCAGTGCCGGATGGATTCTACTTGTTGCAAGACCTGTTGTTAAAGATATGTTTCACTGGCAAGCAACCATCATGGGACCCACAGACAGTCTGTATTCTAGAGACGTATTCTTTGTTACGATCCACTTCCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACTTAAGGTTGCATTTAAGACAAAGGTTTTCCACCCTAATATCAATAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019825
ATGGCTTCAAAGCGTATTTTGAAGGAACTCAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGCAGTGCCGCTAGTAAATCTACTTTCTTATTAGCCTTGTGTCAATTAAAAGACTGTTGTCGGTTATGTATTTTGCTCCTAACCGCTTTGTTTTCTTACCATCTAGGATGGATTCTACTTGTTGCAAGACCTGTTGTTAAAGATATGTTTCACTGGCAAGCAACCATCATGGGACCCACAGACAGTCTGTATTCTAGAGA...

LOC131019825
ATGGCTTCAAAGCGTATTTTGAAGGAACTCAAGGATCTGCAGAAGGATCCTCCTACTTCTTGCAGTGCCGGATGGATTCTACTTGTTGCAAGACCTGTTGTTAAAGATATGTTTCACTGGCAAGCAACCATCATGGGACCCACAGACAGTCTGTATTCTAGAGACGTATTCTTTGTTACGATCCACTTCCCTCCGGATTATCCTTTCAAGCCACTTAAGGTTGCATTTAAGACAAAGGTTTTCCACCCTAATATCAATAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804421.1
MASKRILKELKDLQKDPPTSCSAASKSTFLLALCQLKDCCRLCILLLTALFSYHLGWILLVARPVVKDMFHWQATIMGPTDSLYSRDVFFVTIHFPPDYPFKPLKVAFKTKVFHPNINSNGSICLDILKEQWSPALTISKVLLSICLLLTDSNPDDPLIPEIAHMYKTDRVKYESTAHSWT

XP_057804422.1
MASKRILKELKDLQKDPPTSCSAGWILLVARPVVKDMFHWQATIMGPTDSLYSRDVFFVTIHFPPDYPFKPLKVAFKTKVFHPNINSNGSICLDILKEQWSPALTISKVSLNQVLLSICLLLTDSNPDDPLIPEIAHMYKTDRVKYESTAHSWT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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