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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001117`

染色体: Chr04 坐标: 16060810-16061515 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001117`
名称	SmilChr04G001117
描述	non-specific lipid-transfer protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	16060810 - 16061515 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019841`
GeneID	`131019841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019841`
原始查询	`SmilChr04G001117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid-transfer protein 2-like
产物	non-specific lipid-transfer protein 2-like
Arabidopsis	`AT3G51590` (LTP12) lipid transfer protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824322] identity=43.5; qcov=0.915; evalue=1.14e-23; confidence=medium
Rice	`Os11g0116000` (OsLTP1.12) - identity=53.1; qcov=0.814; evalue=2.43e-27; confidence=medium
GO	GO:0006869 (lipid transport); GO:0008289 (lipid binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804435.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057804436.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804435.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804435.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804435.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:16060990`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A22,B1,B110,B120,B122,B124,B26,B82,B95,D2,D5
`Chr4:16061088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C6
`Chr4:16061172`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr4:16061172`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr4:16061208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B16
`Chr4:16061420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804435.1

121 aa

121

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 13-106 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 31-114 aa

XP_057804436.1

118 aa

118

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 13-106 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 31-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804435.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	13	106	1.9e-07	31.8	Probable lipid transfer
`XP_057804435.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	31	114	8e-13	49.2	Protease inhibitor/seed storage/LTP family
`XP_057804436.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	13	106	6.6e-08	33.3	Probable lipid transfer
`XP_057804436.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	31	114	9e-13	49.0	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948453.1
TATAAACCCCATCACCACACACCCGAAATCATCTAAGGACTCATCACCATTTTCATTTACTTAAAAAAAAAAAACACATCATATCGATCATGGCTGCAATGACCAAGGCAATGTGCGTGGCCCTCATCGCCGTCGTGATGGTGGCGGCGGCCGCACCGCCTGCCGAGGCGGCGATAAACTGCGACACGGTGATCTCATTCTTGAGACCGTGCCACCCATGGGTGAGCAACAAAGGCCCACTTGGGCGCTGCTGCGGCGGA...

XM_057948452.1
TAAACCCCATCACCACACACCCGAAATCATCTAAGGACTCATCACCATTTTCATTTACTTAAAAAAAAAAAACACATCATATCGATCATGGCTGCAATGACCAAGGCAATGTGCGTGGCCCTCATCGCCGTCGTGATGGTGGCGGCGGCCGCACCGCCTGCCGAGGCGGCGATAAACTGCGACACGGTGATCTCATTCTTGAGACCGTGCCACCCATGGGTGAGCAACAAAGGCCCACTTGGGCGCTGCTGCGGCGGAGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019841
ATGGCTGCAATGACCAAGGCAATGTGCGTGGCCCTCATCGCCGTCGTGATGGTGGCGGCGGCCGCACCGCCTGCCGAGGCGGCGATAAACTGCGACACGGTGATCTCATTCTTGAGACCGTGCCACCCATGGGTGAGCAACAAAGGCCCACTTGGGCGCTGCTGCGGCGGAGTCAAGGGACTGAACGGCGCCGCCAAGTCCACCCCCGACCGCCAAAGGGCATGCAGCTGCCTGAAATCCATCGCCGCCAGCAACCCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804435.1
MAAMTKAMCVALIAVVMVAAAAPPAEAAINCDTVISFLRPCHPWVSNKGPLGRCCGGVKGLNGAAKSTPDRQRACSCLKSIAASNPDIILSRAAILPQQCGVNIPYKISLSTDCSNCCGAG

XP_057804436.1
MAAMTKAMCVALIAVVMVAAAAPPAEAAINCDTVISFLRPCHPWVSNKGPLGRCCGGVKGLNGAAKSTPDRQRACSCLKSIAASNPDIILSRAAILPQQCGVNIPYKISLSTDCSKVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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