当前解析结果
SmilChr04G001122| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001122 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001122 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001122 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 16267699 - 16268094 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131019844 |
|---|---|
| GeneID | 131019844 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019844 |
| 原始查询 | SmilChr04G001122 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019844 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057804438.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804438.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804438.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804438.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057804438.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:16267716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C7,C74 |
Chr4:16267718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B59,C60 |
Chr4:16267726 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B59,C60,C72 |
Chr4:16267774 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A15,A7,B114,B44,B45,C24 |
Chr4:16267784 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 15 | A3,A5,B126,B130,B23,B36,B40,B49,B79,B85,B91,C25,C35,C45,C75 |
Chr4:16267789 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B102,B12,B63,C27,C45 |
Chr4:16267799 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C58,C87,D5 |
Chr4:16267821 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B93,C53 |
Chr4:16267928 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B103,B114,B13,B44,B81,D2 |
Chr4:16267934 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B140,B33,C7 |
Chr4:16267950 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B20,B31,B99 |
Chr4:16267958 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。