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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001147`

染色体: Chr04 坐标: 16894816-16896354 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001147`
名称	SmilChr04G001147
描述	probable methyltransferase At1g29790
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	16894816 - 16896354 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019848`
GeneID	`131019848`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019848`
原始查询	`SmilChr04G001147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase At1g29790
产物	probable methyltransferase At1g29790
Arabidopsis	`AT3G05390` (AT3G05390) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819703] identity=43.9; qcov=0.755; evalue=2.37e-95; confidence=medium
Rice	`Os08g0113400` - identity=49; qcov=0.95; evalue=9e-117; confidence=high
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11); PF13649 (Methyltransf_25)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019848

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804442.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057804442.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804442.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804442.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:16895327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr4:16895366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B1,B140,B24,D11
`Chr4:16895445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:16895450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:16895666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:16895747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B133,C17
`Chr4:16895975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804442.1

444 aa

222

444

Methyltransf_29

Methyltransf_25

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 287-389 aa PF13649 Methyltransf_25 295-386 aa PF08241 Methyltransf_11 295-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804442.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	287	389	2.5e-06	27.1	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057804442.1`	Pfam	`PF13649`	Methyltransf_25	Domain	295	386	5.8e-07	30.8	Methyltransferase domain
`XP_057804442.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	295	389	5.6e-09	37.2	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948459.1
GACTATATTTTAATTGGCCTTCACATTGTATATATTTGGAGAAAAGTGCATGGAGTGTAATAAGTCCTATCTTGTTATAGTGAGAGGGAGAGATGGGAAGTGAAGACTCCATCCCAAGAAAGCAAGCATGCCAACAAATTCAAATCACGTACAAGCTCAAAATACTACTCCTAATAGTAGTAACCAACCTCTTGACTATTTACATTTTCACTACCCCTCACTCAAACTTTGATCATCCACTTTCAAGAATCTCCCAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019848
ATGGGAAGTGAAGACTCCATCCCAAGAAAGCAAGCATGCCAACAAATTCAAATCACGTACAAGCTCAAAATACTACTCCTAATAGTAGTAACCAACCTCTTGACTATTTACATTTTCACTACCCCTCACTCAAACTTTGATCATCCACTTTCAAGAATCTCCCAACTCCCCTTTTGGGACACCAAACCCCTCCTCCTCAAGCTCAACTCCACACAAGACCAACTCACCGCGTCTCACTCCCAAATCGCCGACTTGCAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804442.1
MGSEDSIPRKQACQQIQITYKLKILLLIVVTNLLTIYIFTTPHSNFDHPLSRISQLPFWDTKPLLLKLNSTQDQLTASHSQIADLQTQLKSARELLGTLLDRLNRETISQAVQDPSKTFEDMINDIPVLEAKLAIGPHTLPLGNTPWIGSEVYASIGGGCLKHKQDLARYMSYDVGGECPSDDIFAQTLMLKGCEPLPRRRCHPRPPPNYPEPQPLPGSLWATPPDTSIVWDPYTCKNYTCLIERKKFPGSYDCKDCFDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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