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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001148`

染色体: Chr04 坐标: 16927317-16927945 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001148`
名称	SmilChr04G001148
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	16927317 - 16927945 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019855`
GeneID	`131019855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019855`
原始查询	`SmilChr04G001148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
产物	glycine-rich RNA-binding protein RZ1C-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057804458.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804458.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057804458.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057804458.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:16927357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B86,D7
`Chr4:16927367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr4:16927392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr4:16927400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B48,B85,C17,C4
`Chr4:16927401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A24,C3,C74
`Chr4:16927406`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A11,A21,A23,A7,A8,A9,B102,B104,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B12,B129,B131,B137,B2,B20,B24,B32,B34,B35,B36,B4,B46,B49,B53,B55,B58,B66,B73,B77,B79,B84,B86,B87,B89,B93,B97,B98,B99,C10,C12,C14,C23,C24,C25,C26,C33,C34,C42,C5,C59,C60,C63,C71,C72,C76,C81,C82,C83,C84,C9,D6,D8,D9
`Chr4:16927410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C74
`Chr4:16927431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B50,B68,C60
`Chr4:16927489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B14,C62
`Chr4:16927497`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A18,B24
`Chr4:16927497`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A18,B24
`Chr4:16927515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804458.1

91 aa

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 58-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804458.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	58	74	2.9e-08	34.1	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948475.1
TCTAGTTACGGCGGAGGGAGTCATGGGCACTAGGAAAGAGGTTCTTGTCGCTGCCAAGGGATCTACTTCTTCGTCGAAAGGCGGGAAAAAGAAGTGGAAAGGTCCAAAGGGCAAGAATGACAAAGAAGCTAGTGGGAGTGGCAAAGCCAAAGTGGACGGCCCTACCGGCGGTGTGAAGAAGCCGACGGCAAAGGGAAAGTGCTTCAAGTGCGGCAAGACTGGGCATTGGAAGAAAGATTGTCCGATGCTCAAGGCAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019855
ATGGGCACTAGGAAAGAGGTTCTTGTCGCTGCCAAGGGATCTACTTCTTCGTCGAAAGGCGGGAAAAAGAAGTGGAAAGGTCCAAAGGGCAAGAATGACAAAGAAGCTAGTGGGAGTGGCAAAGCCAAAGTGGACGGCCCTACCGGCGGTGTGAAGAAGCCGACGGCAAAGGGAAAGTGCTTCAAGTGCGGCAAGACTGGGCATTGGAAGAAAGATTGTCCGATGCTCAAGGCAAAGGGACAAGGGCTTCAAGCCGACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804458.1
MGTRKEVLVAAKGSTSSSKGGKKKWKGPKGKNDKEASGSGKAKVDGPTGGVKKPTAKGKCFKCGKTGHWKKDCPMLKAKGQGLQADKAAGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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