当前解析结果
SmilChr04G001154| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001154 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001154 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001154 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 17043822 - 17046327 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019854 |
|---|---|
| GeneID | 131019854 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019854 |
| 原始查询 | SmilChr04G001154 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019854 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057804457.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057804457.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057804456.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057804456.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804457.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:17044947 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr4:17045011 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B38 |
Chr4:17045011 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr4:17045081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B101,B63,B83,C46,C82,D7 |
Chr4:17045089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B9,C26 |
Chr4:17045162 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr4:17045185 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B9,C26 |
Chr4:17045377 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D10 |
Chr4:17045377 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:17045976 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B103,C17,C30,C35,C65,C9 |
Chr4:17045987 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,B105,C76 |
Chr4:17046001 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
7 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。