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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001169`

染色体: Chr04 坐标: 17484426-17485847 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001169`
名称	SmilChr04G001169
描述	uncharacterized SmilChr04G001169
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	17484426 - 17485847 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023088`
GeneID	`131023088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023088`
原始查询	`SmilChr04G001169`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0627900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0627900` - identity=56; qcov=0.408; evalue=4.9e-41; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808614.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057808614.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808614.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808614.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808614.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:17484428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,C5
`Chr4:17484430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B132,B135,C17
`Chr4:17484443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B101,B22
`Chr4:17484443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B22
`Chr4:17484444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B124,C68,C77,C85
`Chr4:17484476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B137,B55,C2
`Chr4:17484486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B97,C60,C77
`Chr4:17484487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C18
`Chr4:17484489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B20
`Chr4:17484497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,C29,C7,C87
`Chr4:17484513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B14
`Chr4:17484537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808614.1

284 aa

142

284

SH3_Tf2-1

PF24626 SH3_Tf2-1 228-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808614.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	228	262	9.9e-08	32.7	Tf2-1-like, SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952631.1
ATGCGACAAAGAATATGGCTGGAGTTGGTAAAAGATTACGATTGTGGAATCAATTACCACCCGGAAAAAGCCAATGTCGTCGCCGACGTGTTAAGCAGGAAGAATCAAGTGGAGTTAGGATTTCTCCTTACTCAAGAGAAGAACTTGATCAGAGAATTCGAGAAGATGAAATTGGAGGTAGTAATACCACCCCAGACGGCAGAGAGTATGATTGCTACGCTGAGTATTACCCCCGACCTACGATCGAGGATAGTCACAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023088
ATGCGACAAAGAATATGGCTGGAGTTGGTAAAAGATTACGATTGTGGAATCAATTACCACCCGGAAAAAGCCAATGTCGTCGCCGACGTGTTAAGCAGGAAGAATCAAGTGGAGTTAGGATTTCTCCTTACTCAAGAGAAGAACTTGATCAGAGAATTCGAGAAGATGAAATTGGAGGTAGTAATACCACCCCAGACGGCAGAGAGTATGATTGCTACGCTGAGTATTACCCCCGACCTACGATCGAGGATAGTCACAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808614.1
MRQRIWLELVKDYDCGINYHPEKANVVADVLSRKNQVELGFLLTQEKNLIREFEKMKLEVVIPPQTAESMIATLSITPDLRSRIVTAQREDEKFEKLRSKIRVEKMDGYHEAADNAIMFEGRLCVPNVEDLNNEIMSEAHDTPYVAHPGSTKIFQSTINMAPYEALYGRKCRSPLYWDEVGERKILGPEAIDEMITIVRQIRQRIKEAQDRQKSYADTRRTEIHFDVGDKVFLKVSPSRGVHRFGVKGKLKPRYIGPYDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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