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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001181`

染色体: Chr04 坐标: 17914708-17915253 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001181`
名称	SmilChr04G001181
描述	uncharacterized SmilChr04G001181
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	17914708 - 17915253 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023094`
GeneID	`131023094`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023094`
原始查询	`SmilChr04G001181`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=33.6; qcov=0.641; evalue=2.74e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023094

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808620.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808620.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808620.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808620.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808620.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:17914747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B106,B125,B65,C57
`Chr4:17914756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B81
`Chr4:17914799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:17914880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C60
`Chr4:17914885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C28
`Chr4:17914924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:17914937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A4,B140,B55,D1
`Chr4:17914988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B132
`Chr4:17914989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:17915006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B87
`Chr4:17915010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:17915043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808620.1

181 aa

181

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 78-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808620.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	78	151	3.9e-10	40.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952637.1
ATGGCCAGAACAAGGGGTAACAGGAGACCTCCAGCAGACGAAGAATCTGATAGCGAAGCCACTAAATCGATGGGGAATAGGAATCGAAATCGAAATGATGTTAATACGATGGCCCATGTGCTTGCACAAGCACTGAGAGGAGTATTGCCTCAACAACCGCATCAACCTCAAGCAGAAGGTGGAAATGGAGTAGTAGCTCAATTTCGAAGCATGGCACCGCCAATTCTAAGAGGGAATGAAGGACCCTTAGGGACCGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023094
ATGGCCAGAACAAGGGGTAACAGGAGACCTCCAGCAGACGAAGAATCTGATAGCGAAGCCACTAAATCGATGGGGAATAGGAATCGAAATCGAAATGATGTTAATACGATGGCCCATGTGCTTGCACAAGCACTGAGAGGAGTATTGCCTCAACAACCGCATCAACCTCAAGCAGAAGGTGGAAATGGAGTAGTAGCTCAATTTCGAAGCATGGCACCGCCAATTCTAAGAGGGAATGAAGGACCCTTAGGGACCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808620.1
MARTRGNRRPPADEESDSEATKSMGNRNRNRNDVNTMAHVLAQALRGVLPQQPHQPQAEGGNGVVAQFRSMAPPILRGNEGPLGTEEWMRQMERIFNYMRCKDDLKVTCAAFQLTDDAGHWWESETAALTKEQMRAITWRTFKEKVMGKYFPRAFRKQKEIELMNLEQGNMTVLEYERKFT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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