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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001183`

染色体: Chr04 坐标: 17932247-17936487 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001183`
名称	SmilChr04G001183
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00860-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	17932247 - 17936487 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023096`
GeneID	`131023096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023096`
原始查询	`SmilChr04G001183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=43.9; qcov=0.555; evalue=4.67e-33; confidence=medium
Rice	`Os12g0142900` - identity=39.3; qcov=0.824; evalue=8.14e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808622.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808622.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808622.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808622.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:17932261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B45
`Chr4:17932267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B41,B53
`Chr4:17932271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:17932289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr4:17932292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B16,B87,B94
`Chr4:17932301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B98,C50,C60,C82
`Chr4:17932327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B138,C50,C60,C82
`Chr4:17932332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B66,B70,B82,C79
`Chr4:17932332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B70,B82,C79
`Chr4:17932349`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	35	A18,A19,A4,B100,B107,B118,B128,B13,B138,B19,B27,B35,B4,B51,B54,B59,B70,B77,B79,B85,B91,B94,C22,C26,C29,C5,C52,C64,C66,C71,C74,C83,C85,C86,D3
`Chr4:17932351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B19,B85,C18
`Chr4:17932372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B112,C18,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808622.1

238 aa

119

238

RVT_1

PF00078 RVT_1 3-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808622.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	3	69	1.4e-13	51.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952639.1
ATGGATCTCATGAACAGAGTATTTCATCCTTATTTGGATAAGTTCGTCGTGGTGTTTATTGATGATATTCTCGTCTACTCCAGGAATGAAGAAGAACACAGGGAACATCTGAGAACTGCGTTGCAAACGCTAAGGGATGAATGCCTTTATGCCAAATTCAGCAAATGTGAGTTTTGGCTCAAAGAAGTTACATTTCTGGGACACATTGTGTCTTCAGAAGGTATCAAGGTGGACCCCGCCAAAGTGGAAGCAGTACAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023096
ATGGATCTCATGAACAGAGTATTTCATCCTTATTTGGATAAGTTCGTCGTGGTGTTTATTGATGATATTCTCGTCTACTCCAGGAATGAAGAAGAACACAGGGAACATCTGAGAACTGCGTTGCAAACGCTAAGGGATGAATGCCTTTATGCCAAATTCAGCAAATGTGAGTTTTGGCTCAAAGAAGTTACATTTCTGGGACACATTGTGTCTTCAGAAGGTATCAAGGTGGACCCCGCCAAAGTGGAAGCAGTACAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808622.1
MDLMNRVFHPYLDKFVVVFIDDILVYSRNEEEHREHLRTALQTLRDECLYAKFSKCEFWLKEVTFLGHIVSSEGIKVDPAKVEAVQGWRSPTTPNEIRSFLGLAGYYRRFIEGFSKIARPMTQLLRKGIKYNWTNECEESFQLLKEKLTTAPVLTIPELDKEYVAAGIDSIENSARVLACDPGVAYLNTLVQQRLLLLFHKYARPSYGTRWLHGHTRHICHNLLLVVRERVEPPPGSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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