当前解析结果
SmilChr04G001196| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001196 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001196 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001196 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 18314243 - 18314755 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023100 |
|---|---|
| GeneID | 131023100 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023100 |
| 原始查询 | SmilChr04G001196 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023100 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808627.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808627.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808627.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808627.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808627.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:18314244 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A18,A5,B14,B16,B22,B48,B49,B95,C18,C31,C38,C83,D2 |
Chr4:18314258 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,C78 |
Chr4:18314360 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,B138,C78 |
Chr4:18314378 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,C42,C48 |
Chr4:18314379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B40,B76 |
Chr4:18314395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B78,C33,C58 |
Chr4:18314396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B128 |
Chr4:18314396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B128 |
Chr4:18314411 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B34,B86,C15,C39,D7 |
Chr4:18314430 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr4:18314444 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B40,B76 |
Chr4:18314452 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,B127,B138,B37,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。