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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001220`

染色体: Chr04 坐标: 19060331-19063083 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001220`
名称	SmilChr04G001220
描述	uncharacterized SmilChr04G001220
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19060331 - 19063083 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023692`
GeneID	`131023692`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023692`
原始查询	`SmilChr04G001220`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=30.2; qcov=0.484; evalue=4.03e-14; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023692

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809241.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809241.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809241.1`
4	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057809241.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809241.1

287 aa

144

287

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 186-203 aa

XP_057809242.1

287 aa

144

287

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 186-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809241.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	186	203	1.5e-05	25.6	Zinc knuckle
`XP_057809242.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	186	203	1.5e-05	25.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953258.1
CGGACTATGACTGACGAACAGTGGGAGAATTTCACATGGGAAGAATTCAAGGCTGAATTGTATGAGAAGTATATACCAGGATGTTACCGACAAAAGAAACAGAACGAGTTTTGGAATTTGAGACAGAAAACGGGAACTGTGACCGAGTATGATAGAGCCTTCAATCAGCTATCAAGATATGCTCCGACGTTGGTGGACAGCGATGAGAAACGCGCAGAGAAGTTCAGAAACGGACTGCGTCACGAGATAGCGATTTCCCT...

XM_057953259.1
CGGACTATGACTGACGAACAGTGGGAGAATTTCACATGGGAAGAATTCAAGGCTGAATTGTATGAGAAGTATATACCAGGATGTTACCGACAAAAGAAACAGAACGAGTTTTGGAATTTGAGACAGAAAACGGGAACTGTGACCGAGTATGATAGAGCCTTCAATCAGCTATCAAGATATGCTCCGACGTTGGTGGACAGCGATGAGAAACGCGCAGAGAAGTTCAGAAACGGACTGCGTCACGAGATAGCGATTTCCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131023692
ATGACTGACGAACAGTGGGAGAATTTCACATGGGAAGAATTCAAGGCTGAATTGTATGAGAAGTATATACCAGGATGTTACCGACAAAAGAAACAGAACGAGTTTTGGAATTTGAGACAGAAAACGGGAACTGTGACCGAGTATGATAGAGCCTTCAATCAGCTATCAAGATATGCTCCGACGTTGGTGGACAGCGATGAGAAACGCGCAGAGAAGTTCAGAAACGGACTGCGTCACGAGATAGCGATTTCCCTAGCAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809241.1
MTDEQWENFTWEEFKAELYEKYIPGCYRQKKQNEFWNLRQKTGTVTEYDRAFNQLSRYAPTLVDSDEKRAEKFRNGLRHEIAISLASQGGLTYAQTLSRALTIESLLPREKGKSPEQFGFVPSQDGSKGKRKWNEGTGGNIGNGKKPWTANQNQNQHQNPQPQAIVQTPCPKCQKLHPGECLKGMNVCYNCGEAGHYVSTCPKKGGGAPQQQNPGNQQRQNQGPRGNQNQPRYARAYALNQHRAAGDHGNLAGTINVFDM...

XP_057809242.1
MTDEQWENFTWEEFKAELYEKYIPGCYRQKKQNEFWNLRQKTGTVTEYDRAFNQLSRYAPTLVDSDEKRAEKFRNGLRHEIAISLASQGGLTYAQTLSRALTIESLLPREKGKSPEQFGFVPSQDGSKGKRKWNEGTGGNIGNGKKPWTANQNQNQHQNPQPQAIVQTPCPKCQKLHPGECLKGMNVCYNCGEAGHYVSTCPKKGGGAPQQQNPGNQQRQNQGPRGNQNQPRYARAYALNQHRAAGDHGNLAGTINVFDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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