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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001227`

染色体: Chr04 坐标: 19223497-19226112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001227`
名称	SmilChr04G001227
描述	BEL1-like homeodomain protein 1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19223497 - 19226112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023703`
GeneID	`131023703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023703`
原始查询	`SmilChr04G001227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BEL1-like homeodomain protein 1
产物	BEL1-like homeodomain protein 1
Arabidopsis	`AT2G35940` (BLH1) BEL1-like homeodomain 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818167] identity=63.9; qcov=0.822; evalue=4.95e-31; confidence=medium
Rice	`Os03g0680800` (OsBIHD1) - identity=55.9; qcov=0.788; evalue=6.72e-28; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF05920 (Homeobox_KN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809256.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057809258.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809256.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809256.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19223965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A20,B112,B72
`Chr4:19224132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C76
`Chr4:19224250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,C76,D11
`Chr4:19224255`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A10,A20,B112,B34,B72,C83
`Chr4:19224301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B132,B80,C1,D4
`Chr4:19224428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B112,B132,B80,C1,D4
`Chr4:19224428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B132,B80,C1,D4
`Chr4:19224455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B132,B80,C1,D4
`Chr4:19224468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B122,B53
`Chr4:19224521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809256.1

120 aa

120

Homeobox_KN

PF05920 Homeobox_KN 52-80 aa

XP_057809257.1

120 aa

120

Homeobox_KN

PF05920 Homeobox_KN 52-80 aa

XP_057809258.1

118 aa

118

Homeobox_KN

PF05920 Homeobox_KN 52-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809256.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	52	80	8.8e-07	29.4	Homeobox KN domain
`XP_057809257.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	52	80	8.8e-07	29.4	Homeobox KN domain
`XP_057809258.1`	Pfam	`PF05920`	Homeobox_KN	Family	52	80	8.6e-07	29.4	Homeobox KN domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101491.1
CCTCAATTTCAAAATCAGAAATCTAGGGTTTCAAGTTTCACTTTGAATTTCTCTTTCTCCGGTGAATCTCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCTCGACCGTTCCTCACGCCCTCTGCTCTCATCGTTTCAGGTATTCCTTCTCTCTTACTCGTTCTCTCTCCCCTTGCCATCTACGCTTCCTCACCGATCTCCCTCCGCCCCCTGCTCTCGTTCGCGGCGCCGCCGCGAATCGCCGCTACGTATCCTTGCTATGGTA...

XR_009101490.1
CCTCAATTTCAAAATCAGAAATCTAGGGTTTCAAGTTTCACTTTGAATTTCTCTTTCTCCGGTGAATCTCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCGCTGCTCGACCGTTCCTCACGCCCTCTGCTCTCATCGTTTCAGGTATTCCTTCTCTCTTACTCGTTCTCTCTCCCCTTGCCATCTACGCTTCCTCACCGATCTCCCTCCGCCCCCTGCTCTCGTTCGCGGCGCCGCCGCGAATCGCCGCTACGTATCCTTGCTATGGTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131023703
ATGAAGGCCTTGAACAAGAGCTTGGGGGAGGACCAAGGTTCGGAGCTGCCGAGGCTGAGGTTTGTGGATCGGCAGCAGGTAGGGATGCTGCACAACAATGCGTGGAGACCGCAGAGAGGGCTGCCTGAGAGAGCTGTCTCGGTGCTTCGTGCTTGGCTCTTTCAACACTTTCTTCATCCGTACCTTAAGAACTCGGATAAGCAAATGCTTGCTAAGCAAACAGGGCTTACCAGGATTCAGGATGGTAAGCTGAATTCACT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809256.1
MKALNKSLGEDQGSELPRLRFVDRQQVGMLHNNAWRPQRGLPERAVSVLRAWLFQHFLHPYLKNSDKQMLAKQTGLTRIQDGKLNSLEDKQVRVLLQMRCSCLGSLWLFISIIFSTCVMF

XP_057809257.1
MKALNKSLGEDQGSELPRLRFVDRQQVGMLHNNAWRPQRGLPERAVSVLRAWLFQHFLHPYLKNSDKQMLAKQTGLTRIQDGKLNSLEDKQVRVLLQMRCSCLGSLWLFISIIFSTCVMF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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