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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001231`

染色体: Chr04 坐标: 19347079-19348048 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001231`
名称	SmilChr04G001231
描述	uncharacterized SmilChr04G001231
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19347079 - 19348048 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023110`
GeneID	`131023110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023110`
原始查询	`SmilChr04G001231`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0271500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0271500` - identity=31.1; qcov=0.962; evalue=1.81e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808636.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057808636.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808636.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808636.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19347186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B53
`Chr4:19347190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B80,B82,C87,D5
`Chr4:19347212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr4:19347232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C53
`Chr4:19347234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:19347239`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr4:19347239`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr4:19347368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B132,B27,B75
`Chr4:19347388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B8,C14
`Chr4:19347399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B68,C37,C50,C75
`Chr4:19347402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,C27,C53,D4
`Chr4:19347421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C60,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808636.1

234 aa

117

234

DUF4216

PF13952 DUF4216 105-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808636.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	105	162	5.1e-16	59.7	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952653.1
CATATATCAAGTGAGTATTGTTGACTCAATTTATGTATATCAATTATCGACGTACGTAACTTATAACTTTTTTCGTTATATCTTAGGATCTTCGAGGACGAAATGCGCTACGTAAATCCTTCACTAACCGAAGCGGAGTTAGAGAGTGCTTTCGACAAGGATTTTATGTTGTGGTTTGGCCATTATGTGATTCGCCCTTCTAACAATGATTTGAACCCGTATATCAAGTCGCTTGCAGCCGGGCCTTTAACTGAGATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023110
ATGCGCTACGTAAATCCTTCACTAACCGAAGCGGAGTTAGAGAGTGCTTTCGACAAGGATTTTATGTTGTGGTTTGGCCATTATGTGATTCGCCCTTCTAACAATGATTTGAACCCGTATATCAAGTCGCTTGCAGCCGGGCCTTTAACTGAGATTGAGACATACTCCGGGTATTTTGTGAATGGCTATAGATTTCACACGACTGATCTTGATGGAGAGCGCGCAACTGTGAACAGTGGCGTGTGCATAAAAGGCTCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808636.1
MRYVNPSLTEAELESAFDKDFMLWFGHYVIRPSNNDLNPYIKSLAAGPLTEIETYSGYFVNGYRFHTTDLDGERATVNSGVCIKGSVYGRDVQDFYGRLQEVCVLEYGGYPIKKTVLFKCEWFDLSARGTSIDTNFKLVSVNQTRKYQKYDPFVLASQAVQVEVSTAASNLTLHQPFQEEVVTITSTHTSVDIDPPILVHPLGGIVDIEDDDDPEDDDQPLTSDDDASNDDDSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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