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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001237`

染色体: Chr04 坐标: 19385278-19390362 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001237`
名称	SmilChr04G001237
描述	uncharacterized SmilChr04G001237
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19385278 - 19390362 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023701`
GeneID	`131023701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023701`
原始查询	`SmilChr04G001237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPA1C; symbol=RPA1C; hit=Os05g0111000; species=rice; confidence=low
产物	RPA1C; symbol=RPA1C; hit=Os05g0111000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os05g0111000` (RPA1C) - identity=44.1; qcov=0.431; evalue=4.81e-06; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809255.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057809255.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809255.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809255.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19388319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A9,B87
`Chr4:19388350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B117
`Chr4:19388368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:19388379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C3,C5
`Chr4:19388381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B5,C60,C63
`Chr4:19388382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B131,C8
`Chr4:19388418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:19388442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:19388450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:19388464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr4:19388490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B19,B27,C56,C60
`Chr4:19388508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809255.1

137 aa

137

zf-CCHC

PF00098 zf-CCHC 66-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809255.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	66	82	3.8e-07	30.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101487.1
CATAAATTGACGTATTTGTTTTAACATTAAGAGCTTCGTACTTTTATATCTCTCCATGCATGTGAATGGTAAGGTGGTGGAAGCTTTCAAGATGATATATAGAAATGATAAGCAAGCATGACAAGTTAGTCCTATTTGGGATTTAAGAAATGAGAAGAGATTGAAGGGGATATTCGATCGAAAGATCGAACTTTATGGGGCAAACAGATTTATTATGCCTTTAATGAATCACTATGAACGACGAGAAAAGTACGTGCAGA...

XR_009101483.1
CATAAATTGACGTATTTGTTTTAACATTAAGAGCTTCGTACTTTTATATCTCTCCATGCATGTGAATGGTAAGGTGGTGGAAGCTTTCAAGATGATATATAGAAATGATAAGCAAGCATGACAAGTTAGTCCTATTTGGGATTTAAGAAATGAGAAGAGATTGAAGGGGATATTCGATCGAAAGATCGAACTTTATGGGGCAAACAGATTTATTATGCCTTTAATGAATCACTATGAACGACGAGAAAAGTACGTGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023701
ATGTGTCAGCACAAGCACCGACCCAAAACTATGAAAAAAATGAAACGTAAATGGGAAGGCGGAAATGATGGGAACCCAGGAAAAATGAAGCAACCATGGAGAGGAACTCAGCAGCAACAAGGACATACTGAAGGAAAGCCTTTATGCCCAACATGTCAGAAAAATCACTATGGTGAATGTAAGATAGGCTCCAACCACTGCTTTAGGTGCAAGCAACCAGGGCATTTCGCCAGAGACTGCCCAAATAATAACGGGAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809255.1
MCQHKHRPKTMKKMKRKWEGGNDGNPGKMKQPWRGTQQQQGHTEGKPLCPTCQKNHYGECKIGSNHCFRCKQPGHFARDCPNNNGNMRIPQPQNLAPHRPNQVPIGNERPNQRQPARARAYALNQQQAAQAPEDLEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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